17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0885 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0885  hypothetical protein  100 
 
 		 482 aa  976    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3579  hypothetical protein  55.74 
 
 		 494 aa  476  1e-133  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1111  hypothetical protein  50.22 
 
 		 484 aa  408  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.255858  hitchhiker  0.000181601 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2668  hypothetical protein  48.39 
 
 		 494 aa  392  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3940  hypothetical protein  43.82 
 
 		 488 aa  372  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1359  hypothetical protein  30.29 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0327501  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3824  hypothetical protein  30.56 
 
 		 231 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112724  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2790  hypothetical protein  29.35 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0586384  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0110  hypothetical protein  29.41 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00209579  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0117  hypothetical protein  29.07 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3639  hypothetical protein  27.18 
 
 		 220 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3753  hypothetical protein  27.14 
 
 		 224 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0227432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1555  hypothetical protein  27.18 
 
 		 220 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4312  hypothetical protein  27.18 
 
 		 220 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.85549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3878  hypothetical protein  26.15 
 
 		 220 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2518  hypothetical protein  27.17 
 
 		 228 aa  52  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.272562  normal  0.775663 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3230  hypothetical protein  24.86 
 
 		 192 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>