17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2790 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2790  hypothetical protein  100 
 
 		 272 aa  568  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0586384  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2518  hypothetical protein  86.4 
 
 		 228 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.272562  normal  0.775663 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3753  hypothetical protein  64.09 
 
 		 224 aa  296  3e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0227432  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4312  hypothetical protein  66 
 
 		 220 aa  284  9e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.85549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3878  hypothetical protein  62.27 
 
 		 220 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1555  hypothetical protein  66 
 
 		 220 aa  280  1e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3639  hypothetical protein  67.2 
 
 		 220 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3824  hypothetical protein  38.57 
 
 		 231 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0110  hypothetical protein  39.05 
 
 		 231 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00209579  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1359  hypothetical protein  36.36 
 
 		 209 aa  148  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0327501  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0117  hypothetical protein  42.7 
 
 		 195 aa  145  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3230  hypothetical protein  35.61 
 
 		 192 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3377  hypothetical protein  35.43 
 
 		 170 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0885  hypothetical protein  29.35 
 
 		 482 aa  58.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1111  hypothetical protein  29.44 
 
 		 484 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.255858  hitchhiker  0.000181601 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3579  hypothetical protein  27.68 
 
 		 494 aa  52  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46491  predicted protein  25.75 
 
 		 385 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.427203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>