31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3230 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3230  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  394  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0117  hypothetical protein  54.07 
 
 
195 aa  195  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1359  hypothetical protein  40.5 
 
 
209 aa  149  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0327501  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3824  hypothetical protein  38.29 
 
 
231 aa  131  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112724  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0110  hypothetical protein  37.14 
 
 
231 aa  129  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00209579  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2518  hypothetical protein  37.13 
 
 
228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.272562  normal  0.775663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3639  hypothetical protein  41.99 
 
 
220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331462  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3878  hypothetical protein  40.88 
 
 
220 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1555  hypothetical protein  40.66 
 
 
220 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4312  hypothetical protein  40.66 
 
 
220 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.85549  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2790  hypothetical protein  35.61 
 
 
272 aa  120  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0586384  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3753  hypothetical protein  34.62 
 
 
224 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0227432  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1111  hypothetical protein  26.84 
 
 
484 aa  58.5  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.255858  hitchhiker  0.000181601 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3579  hypothetical protein  27.51 
 
 
494 aa  53.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3377  hypothetical protein  27.63 
 
 
170 aa  52  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0586  hypothetical protein  25 
 
 
189 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.634561  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0566  hypothetical protein  25 
 
 
189 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.963257  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1304  hypothetical protein  25 
 
 
189 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0791  hypothetical protein  25 
 
 
189 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.554817  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1527  hypothetical protein  25.14 
 
 
189 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.963854  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2668  hypothetical protein  25.49 
 
 
494 aa  50.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1631  hypothetical protein  25.14 
 
 
189 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1496  hypothetical protein  25.14 
 
 
189 aa  49.7  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315094  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46491  predicted protein  26.92 
 
 
385 aa  49.3  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.427203  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2760  hypothetical protein  25.14 
 
 
189 aa  48.1  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117203  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3752  hypothetical protein  30.17 
 
 
196 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0885  hypothetical protein  24.86 
 
 
482 aa  46.2  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0884  hypothetical protein  23.87 
 
 
235 aa  45.8  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0389371 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6733  hypothetical protein  24.18 
 
 
190 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317849  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0864  hypothetical protein  25.71 
 
 
189 aa  42  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.499828 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3940  hypothetical protein  24.75 
 
 
488 aa  41.2  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.634833 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>