33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0117 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0117  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  400  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3230  hypothetical protein  52.2 
 
 		 192 aa  198  3.9999999999999996e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1359  hypothetical protein  43.33 
 
 		 209 aa  154  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0327501  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3824  hypothetical protein  42.42 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0110  hypothetical protein  41.24 
 
 		 231 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00209579  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2790  hypothetical protein  40.5 
 
 		 272 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0586384  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2518  hypothetical protein  40.56 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.272562  normal  0.775663 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3878  hypothetical protein  40 
 
 		 220 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4312  hypothetical protein  40 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.85549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3753  hypothetical protein  41.01 
 
 		 224 aa  142  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0227432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1555  hypothetical protein  41.01 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3639  hypothetical protein  39.78 
 
 		 220 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331462  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3377  hypothetical protein  30.32 
 
 		 170 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1111  hypothetical protein  29.47 
 
 		 484 aa  63.5  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.255858  hitchhiker  0.000181601 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1496  hypothetical protein  31.11 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315094  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0791  hypothetical protein  30.64 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.554817  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1631  hypothetical protein  30.64 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1304  hypothetical protein  30.64 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0586  hypothetical protein  30.64 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.634561  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1527  hypothetical protein  30.64 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.963854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0566  hypothetical protein  30.64 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.963257  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3579  hypothetical protein  27.88 
 
 		 494 aa  58.2  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0885  hypothetical protein  29.07 
 
 		 482 aa  57  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2760  hypothetical protein  30.17 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117203  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5716  hypothetical protein  26.52 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2607  hypothetical protein  28.4 
 
 		 185 aa  51.2  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.611734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2668  hypothetical protein  25.14 
 
 		 494 aa  51.2  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0864  hypothetical protein  25.93 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.499828 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0884  hypothetical protein  28.43 
 
 		 235 aa  46.2  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0389371 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46491  predicted protein  23.14 
 
 		 385 aa  44.3  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.427203  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3940  hypothetical protein  23.12 
 
 		 488 aa  42.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2253  hypothetical protein  23.3 
 
 		 184 aa  42.4  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6733  hypothetical protein  26.79 
 
 		 190 aa  42  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317849  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>