17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1111 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1111  hypothetical protein  100 
 
 
484 aa  984    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.255858  hitchhiker  0.000181601 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3579  hypothetical protein  52.06 
 
 
494 aa  473  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2668  hypothetical protein  50.31 
 
 
494 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3940  hypothetical protein  52.17 
 
 
488 aa  459  9.999999999999999e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.634833 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0885  hypothetical protein  48.39 
 
 
482 aa  429  1e-119  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3824  hypothetical protein  32.98 
 
 
231 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112724  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0110  hypothetical protein  32.28 
 
 
231 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00209579  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1359  hypothetical protein  30.77 
 
 
209 aa  67  0.0000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0327501  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3753  hypothetical protein  31.1 
 
 
224 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0227432  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0117  hypothetical protein  29.47 
 
 
195 aa  63.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3230  hypothetical protein  26.84 
 
 
192 aa  58.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2790  hypothetical protein  29.44 
 
 
272 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0586384  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3639  hypothetical protein  27.81 
 
 
220 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331462  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1555  hypothetical protein  28.74 
 
 
220 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4312  hypothetical protein  27.54 
 
 
220 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.85549  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3878  hypothetical protein  26.95 
 
 
220 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2518  hypothetical protein  28.25 
 
 
228 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.272562  normal  0.775663 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>