21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46491 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_46491  predicted protein  100 
 
 
385 aa  804    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.427203  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3639  hypothetical protein  24.44 
 
 
220 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.331462  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3377  hypothetical protein  27.13 
 
 
170 aa  55.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3878  hypothetical protein  23.5 
 
 
220 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1555  hypothetical protein  23.2 
 
 
220 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4770  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
168 aa  50.1  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.12947  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4312  hypothetical protein  22.65 
 
 
220 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.85549  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3230  hypothetical protein  26.92 
 
 
192 aa  49.3  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3753  hypothetical protein  22.47 
 
 
224 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0227432  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6733  hypothetical protein  28.74 
 
 
190 aa  47  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317849  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2760  hypothetical protein  26.06 
 
 
189 aa  47  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117203  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2518  hypothetical protein  24.51 
 
 
228 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.272562  normal  0.775663 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1304  hypothetical protein  26.06 
 
 
189 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0566  hypothetical protein  26.06 
 
 
189 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.963257  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1496  hypothetical protein  26.06 
 
 
189 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315094  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1527  hypothetical protein  26.06 
 
 
189 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.963854  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0586  hypothetical protein  26.06 
 
 
189 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.634561  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1631  hypothetical protein  26.06 
 
 
189 aa  45.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0791  hypothetical protein  26.06 
 
 
189 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.554817  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2790  hypothetical protein  25.75 
 
 
272 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0586384  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0117  hypothetical protein  23.14 
 
 
195 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>