20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3752 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_3752  hypothetical protein  100 
 
 
196 aa  396  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6733  hypothetical protein  38.92 
 
 
190 aa  108  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317849  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2253  hypothetical protein  35.53 
 
 
184 aa  104  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0791  hypothetical protein  33.68 
 
 
189 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.554817  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0586  hypothetical protein  33.68 
 
 
189 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.634561  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0566  hypothetical protein  33.68 
 
 
189 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.963257  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1304  hypothetical protein  33.68 
 
 
189 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1496  hypothetical protein  33.68 
 
 
189 aa  99.8  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315094  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1527  hypothetical protein  33.68 
 
 
189 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.963854  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1631  hypothetical protein  33.68 
 
 
189 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2760  hypothetical protein  34.76 
 
 
189 aa  97.8  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.117203  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2607  hypothetical protein  35.42 
 
 
185 aa  89  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.611734  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5716  hypothetical protein  37.24 
 
 
186 aa  88.2  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.89569 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0864  hypothetical protein  29.38 
 
 
189 aa  60.5  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.381602  normal  0.499828 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1359  hypothetical protein  30.39 
 
 
209 aa  48.9  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0327501  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3824  hypothetical protein  30.6 
 
 
231 aa  48.1  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112724  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0110  hypothetical protein  30.6 
 
 
231 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00209579  normal  0.608248 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3230  hypothetical protein  30.17 
 
 
192 aa  46.2  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3377  hypothetical protein  32.54 
 
 
170 aa  45.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46491  predicted protein  25.42 
 
 
385 aa  42.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.427203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>