More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0290 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0290  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 220 aa  454  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.438239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0245  phosphoglycerate mutase  88.64 
 
 		 220 aa  413  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.044549 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0267  Phosphoglycerate mutase  50.95 
 
 		 232 aa  187  9e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0998048 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3207  phosphoglycerate mutase  41.98 
 
 		 231 aa  155  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.155022  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5917  phosphoglycerate mutase  37.9 
 
 		 238 aa  118  6e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2350  phosphoglycerate mutase  36.92 
 
 		 221 aa  111  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.111724 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4800  phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  34.91 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  33.65 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  33.96 
 
 		 220 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 217 aa  88.2  8e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  32.86 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  33.97 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  33.97 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 		 220 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  33.13 
 
 		 208 aa  86.3  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  34.13 
 
 		 220 aa  85.5  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  32.86 
 
 		 223 aa  85.1  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  34.13 
 
 		 229 aa  85.1  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  31.8 
 
 		 225 aa  85.1  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  34.29 
 
 		 363 aa  85.1  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  36.81 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  34.42 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  34.12 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.31 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  33.65 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  35.14 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  33.65 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  33.65 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  37.13 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  33.65 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  33.65 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  34.11 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  30.53 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  39.88 
 
 		 440 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  32.42 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  30.52 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  30.53 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3241  phosphoglycerate mutase family protein  30.07 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0777453  normal  0.210221 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  32.39 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1929  phosphoglycerate mutase family protein  30.07 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0606  phosphoglycerate mutase  29.3 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1881  phosphoglycerate mutase  30.07 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1926  phosphoglycerate mutase  30.07 
 
 		 196 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00641926  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2107  phosphoglycerate mutase family protein  30.07 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  37.11 
 
 		 208 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2076  phosphoglycerate mutase family protein  30.07 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  32.55 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2066  phosphoglycerate mutase family protein  30.52 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3949  Phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00773926  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2175  phosphoglycerate mutase family protein  30.07 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.778045  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2160  phosphoglycerate mutase family protein  29.87 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1891  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  31.92 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  36.65 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  35.29 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  35.62 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  35.07 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  30.14 
 
 		 240 aa  75.9  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  28.98 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  34.91 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  32.08 
 
 		 223 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3506  Phosphoglycerate mutase  30.66 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  31.93 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  32.27 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.91 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.91 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1329  phosphoglyceromutase  30.11 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  30.41 
 
 		 201 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  32.68 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  33.75 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  37.25 
 
 		 452 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  24.66 
 
 		 442 aa  73.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.56 
 
 		 442 aa  73.2  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  31.33 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  35 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.06 
 
 		 427 aa  72.8  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  33.13 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  30.38 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  30.54 
 
 		 217 aa  72  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.59 
 
 		 442 aa  72.4  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  32.53 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0562  phosphoglycerate mutase  34.57 
 
 		 185 aa  72  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434916 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  37.41 
 
 		 382 aa  71.6  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.09 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2007  Phosphoglycerate mutase  36.51 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00274439  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  32.51 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  32.94 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  33.65 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0990  phosphoglyceromutase  30.11 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>