295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4800 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4800  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
225 aa  454  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2350  phosphoglycerate mutase  60 
 
 
221 aa  247  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.111724 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5917  phosphoglycerate mutase  55.98 
 
 
238 aa  221  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0267  Phosphoglycerate mutase  35.11 
 
 
232 aa  105  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0998048 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0290  phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 
220 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.438239  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0245  phosphoglycerate mutase  35.19 
 
 
220 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.044549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5342  hypothetical protein  48.57 
 
 
158 aa  99.8  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3207  phosphoglycerate mutase  28.99 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.155022  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  32.23 
 
 
229 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  32.23 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  32.23 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  25.26 
 
 
207 aa  75.9  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2822  Phosphoglycerate mutase  35.91 
 
 
223 aa  74.7  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  29.44 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  31.75 
 
 
229 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  31.75 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  31.75 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  31.75 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  30.09 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2007  Phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00274439  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2175  phosphoglycerate mutase family protein  26.83 
 
 
196 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.778045  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1881  phosphoglycerate mutase  26.83 
 
 
196 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2160  phosphoglycerate mutase family protein  27.32 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  27.8 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  30.09 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2605  phosphoglycerate mutase family protein  27.62 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1891  phosphoglycerate mutase  26.96 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 
202 aa  69.7  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  33.92 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  26.51 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  29.72 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  35.47 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  33.92 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  33.92 
 
 
221 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  28.37 
 
 
226 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1926  phosphoglycerate mutase  26.34 
 
 
196 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00641926  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  31.02 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  23.61 
 
 
233 aa  68.6  0.00000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0587  Phosphoglycerate mutase  34.42 
 
 
183 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1929  phosphoglycerate mutase family protein  27.22 
 
 
196 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2076  phosphoglycerate mutase family protein  27.22 
 
 
196 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2107  phosphoglycerate mutase family protein  27.22 
 
 
196 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  27.91 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3241  phosphoglycerate mutase family protein  25.85 
 
 
196 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0777453  normal  0.210221 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  30.09 
 
 
214 aa  67.4  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2066  phosphoglycerate mutase family protein  25.85 
 
 
196 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  33.33 
 
 
213 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  28.48 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  30 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  29.01 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  28.48 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  29.94 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  28.24 
 
 
220 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  28.75 
 
 
205 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  28.75 
 
 
203 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  28.57 
 
 
203 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  30.32 
 
 
221 aa  63.2  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  28.57 
 
 
203 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  25.37 
 
 
203 aa  62.8  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  26.84 
 
 
188 aa  62.8  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  28.57 
 
 
203 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  27.23 
 
 
214 aa  62.8  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  33.63 
 
 
220 aa  62.8  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  27.04 
 
 
196 aa  62.4  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 
245 aa  62  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  31.64 
 
 
208 aa  62  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35690  fructose-2,6-bisphosphatase  33.12 
 
 
202 aa  60.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  29.33 
 
 
241 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3949  Phosphoglycerate mutase  30.94 
 
 
232 aa  60.1  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00773926  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 
223 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  28.05 
 
 
240 aa  59.7  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  28.77 
 
 
218 aa  58.5  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3303  phosphoglycerate mutase  27.52 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  27.95 
 
 
210 aa  58.2  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  30.23 
 
 
223 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  28.44 
 
 
218 aa  57.8  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2906  Phosphoglycerate mutase  31.6 
 
 
219 aa  57  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.244907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  33.76 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  25.9 
 
 
209 aa  57.4  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  27.67 
 
 
203 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  25.66 
 
 
223 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 
401 aa  56.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0606  phosphoglycerate mutase  28.12 
 
 
218 aa  56.6  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  34.59 
 
 
192 aa  56.2  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  25.15 
 
 
228 aa  56.2  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  29.48 
 
 
217 aa  56.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  27.1 
 
 
223 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  23.96 
 
 
205 aa  55.8  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0928  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 
201 aa  55.8  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  34.94 
 
 
452 aa  55.5  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 
253 aa  55.5  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  28.64 
 
 
209 aa  55.5  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  29.76 
 
 
213 aa  55.5  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3778  phosphoglycerate mutase  27.66 
 
 
207 aa  55.5  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  30.82 
 
 
213 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  30.32 
 
 
199 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  33.74 
 
 
220 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  19.7 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  22.17 
 
 
207 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>