208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2350 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2350  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 221 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.111724 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4800  phosphoglycerate mutase  60 
 
 		 225 aa  247  1e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5917  phosphoglycerate mutase  58.74 
 
 		 238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0245  phosphoglycerate mutase  37.32 
 
 		 220 aa  111  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.044549 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0290  phosphoglycerate mutase  36.92 
 
 		 220 aa  111  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.438239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5342  hypothetical protein  49.49 
 
 		 158 aa  105  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0267  Phosphoglycerate mutase  32.2 
 
 		 232 aa  96.7  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0998048 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3207  phosphoglycerate mutase  26.7 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.155022  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  28.11 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  34.55 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  31.48 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  28.84 
 
 		 213 aa  62  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  25.73 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2637  phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00707522  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  32.69 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3949  Phosphoglycerate mutase  30.41 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00773926  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1203  phosphoglycerate mutase  25.73 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2822  Phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2250  Phosphoglycerate mutase  29.86 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.408643 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  26.57 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  28.44 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0055  Phosphoglycerate mutase  24.24 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0249484  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2605  phosphoglycerate mutase family protein  29.05 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  23.56 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  23.11 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0464  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  27.96 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  26.79 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  26.98 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  26.13 
 
 		 401 aa  56.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  27.06 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  25.84 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  28.37 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1926  phosphoglycerate mutase  25.85 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00641926  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3036  Phosphoglycerate mutase  25.11 
 
 		 258 aa  55.5  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.943102 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3241  phosphoglycerate mutase family protein  25.85 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0777453  normal  0.210221 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1929  phosphoglycerate mutase family protein  26.34 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2076  phosphoglycerate mutase family protein  26.34 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2107  phosphoglycerate mutase family protein  26.34 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0928  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  27.38 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  27.68 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2175  phosphoglycerate mutase family protein  25.85 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.778045  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  27.38 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  27.38 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1881  phosphoglycerate mutase  25.37 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  31.11 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3506  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  22.94 
 
 		 240 aa  54.3  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  27.31 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  28.42 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  22.16 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1891  phosphoglycerate mutase  25.85 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1026  Phosphoglycerate mutase  27.88 
 
 		 182 aa  53.1  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2066  phosphoglycerate mutase family protein  24.88 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 233 aa  53.1  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2160  phosphoglycerate mutase family protein  25.85 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  26.95 
 
 		 203 aa  52.8  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  26.95 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2906  Phosphoglycerate mutase  27.12 
 
 		 219 aa  52.8  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.244907 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0562  phosphoglycerate mutase  29.74 
 
 		 185 aa  52  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434916 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  27.65 
 
 		 203 aa  52  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  27.65 
 
 		 203 aa  52  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2906  Phosphoglycerate mutase  26.09 
 
 		 191 aa  51.6  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0508336  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.79 
 
 		 203 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.29 
 
 		 201 aa  51.6  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  26.79 
 
 		 203 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  26.79 
 
 		 203 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  26.95 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  28.82 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  27.65 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  26.95 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  25.35 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20020  fructose-2,6-bisphosphatase  26.23 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.286624  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2776  Phosphoglycerate mutase  27.18 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787137  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  26.35 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1760  phosphoglycerate mutase family protein  24.03 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000115709  normal  0.449804 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  24.77 
 
 		 442 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  27.87 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3981  phosphoglycerate mutase family protein  22.86 
 
 		 192 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181997  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2434  phosphoglyceromutase  28.89 
 
 		 212 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  25.65 
 
 		 369 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4049  phosphoglycerate mutase family protein  22.86 
 
 		 192 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00510516  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0318  Phosphoglycerate mutase  27.81 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.345198  normal  0.0116481 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  25.93 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  26.42 
 
 		 440 aa  49.3  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1136  phosphoglycerate mutase  26.76 
 
 		 235 aa  49.7  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0728  phosphoglycerate mutase  31.32 
 
 		 195 aa  49.7  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1730  phosphoglycerate mutase  20.69 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  28.57 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.24 
 
 		 201 aa  49.3  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  23.16 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  23.16 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01160  fructose-2,6-bisphosphatase  27.89 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  28.02 
 
 		 452 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3846  phosphoglycerate mutase family protein  22.86 
 
 		 192 aa  48.5  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000331625  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3694  phosphoglycerate mutase family protein  22.86 
 
 		 192 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0148524  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4144  phosphoglycerate mutase family protein  22.86 
 
 		 192 aa  48.5  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2729  phosphoglyceromutase  28.33 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.228083 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2506  phosphoglyceromutase  28.33 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.428069  normal  0.0792311 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>