More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2906 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2906  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 191 aa  390  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0508336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2637  phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 		 190 aa  110  9e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00707522  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 		 190 aa  109  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1203  phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 		 190 aa  108  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3981  phosphoglycerate mutase family protein  32.98 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181997  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4049  phosphoglycerate mutase family protein  32.98 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00510516  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3846  phosphoglycerate mutase family protein  32.46 
 
 		 192 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000331625  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3677  phosphoglycerate mutase family protein  32.46 
 
 		 192 aa  102  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4144  phosphoglycerate mutase family protein  32.46 
 
 		 192 aa  102  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3949  phosphoglycerate mutase family protein  32.46 
 
 		 192 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3694  phosphoglycerate mutase family protein  32.47 
 
 		 192 aa  102  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0148524  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  36.96 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3761  phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 		 190 aa  98.6  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.300708  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 		 209 aa  97.8  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  32.8 
 
 		 217 aa  96.3  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3374  Phosphoglycerate mutase  34.64 
 
 		 189 aa  95.1  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.0226984 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0069  broad-specificity phosphatase PhoE  35.79 
 
 		 197 aa  94.4  9e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0300  Phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 		 197 aa  92  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  35.14 
 
 		 227 aa  92  5e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 		 240 aa  91.7  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 		 237 aa  91.7  7e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  34.24 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20020  fructose-2,6-bisphosphatase  30.81 
 
 		 226 aa  89.4  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.286624  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  36.63 
 
 		 209 aa  89.4  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 		 200 aa  87.8  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  31.02 
 
 		 205 aa  85.9  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  34.22 
 
 		 213 aa  85.9  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  31.89 
 
 		 224 aa  85.1  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 		 206 aa  84.7  8e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  35.08 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  32.48 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  35.08 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  35.08 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  35.08 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  35.08 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  34.2 
 
 		 229 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  35.08 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  34.15 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  35.08 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  30.88 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  33.52 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  31.5 
 
 		 213 aa  81.3  0.000000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  31.85 
 
 		 213 aa  81.3  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  28.22 
 
 		 209 aa  81.3  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  31.85 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  32.61 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  31.79 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  32.07 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  30.5 
 
 		 209 aa  77.8  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1760  phosphoglycerate mutase family protein  30.72 
 
 		 199 aa  77.8  0.00000000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000115709  normal  0.449804 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  32.32 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  29.85 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  32.99 
 
 		 220 aa  76.3  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  31.68 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  31.68 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  30.62 
 
 		 230 aa  76.3  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  34.43 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0630  Phosphoglycerate mutase  32.94 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0549473 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  31.72 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  32.61 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  32.61 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.52 
 
 		 442 aa  75.5  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2108  fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  32.89 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.317681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4423  Phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 		 222 aa  75.1  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.120144 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3671  phosphoglycerate mutase  33.75 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.786994  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  35.9 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  34.71 
 
 		 249 aa  74.7  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0369  phosphoglycerate mutase  29.83 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  31.48 
 
 		 235 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  29.84 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  29.84 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  29.84 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  29.84 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  31.48 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  29.84 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.11 
 
 		 442 aa  72.8  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  32.1 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  33.12 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  31.72 
 
 		 221 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>