More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1248 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 220 aa  426  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  44.38 
 
 		 205 aa  111  8.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  35.32 
 
 		 214 aa  98.6  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  34.3 
 
 		 201 aa  98.6  7e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  34.3 
 
 		 201 aa  98.6  7e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  35.32 
 
 		 214 aa  98.6  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  38.5 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  36.45 
 
 		 208 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  34.68 
 
 		 212 aa  93.2  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  28.21 
 
 		 201 aa  92  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  40.12 
 
 		 207 aa  92  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  32.28 
 
 		 196 aa  91.7  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 209 aa  90.9  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  35.64 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  36.87 
 
 		 213 aa  90.5  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  34.08 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  36.49 
 
 		 240 aa  89  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  32.76 
 
 		 215 aa  88.6  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  37.21 
 
 		 227 aa  88.6  7e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  34.3 
 
 		 209 aa  88.2  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  35.12 
 
 		 202 aa  88.2  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  34.3 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  36.54 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  34.74 
 
 		 212 aa  87.4  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  34.26 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  39.89 
 
 		 205 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  37.67 
 
 		 226 aa  85.1  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  37.67 
 
 		 226 aa  85.1  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  33.93 
 
 		 223 aa  84.7  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  34.47 
 
 		 445 aa  84  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  39.49 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  39.77 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  31.07 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  34.22 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  36.24 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  33.93 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  38.65 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  33.95 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  36.02 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  31.55 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  33.73 
 
 		 207 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  40.12 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  39.76 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  40.43 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0545  Phosphoglycerate mutase  32.57 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000658499 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2906  Phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0508336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3303  phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  33.83 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0146  Phosphoglycerate mutase  33.18 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2898  Phosphoglycerate mutase  29.58 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  37.11 
 
 		 251 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  32.54 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  31.07 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  32.59 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1188  phosphoglycerate mutase family protein  29.95 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0344076  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0055  Phosphoglycerate mutase  29.73 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0249484  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4423  Phosphoglycerate mutase  32.62 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.120144 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  31.56 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1203  phosphoglycerate mutase  32.8 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  39.04 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  33.82 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  32.3 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  32.3 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 209 aa  74.7  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2637  phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 190 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00707522  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  31.53 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  35.43 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  30.38 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.07 
 
 		 442 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3343  Phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  27.4 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  29.86 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  37.57 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  36.71 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  30.32 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  32.7 
 
 		 206 aa  73.9  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.06 
 
 		 442 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  31.11 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  29.86 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1638  Phosphoglycerate mutase  37.58 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.198113 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  33.92 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  30.64 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  35.2 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  29.86 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.43 
 
 		 443 aa  72.4  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  29.86 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  29.86 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1824  Phosphoglycerate mutase  31.74 
 
 		 194 aa  72  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  5.87879e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  29.86 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.83 
 
 		 442 aa  72  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  30.36 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  31.75 
 
 		 190 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  26.92 
 
 		 228 aa  72  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.81 
 
 		 212 aa  72  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  30.06 
 
 		 208 aa  72  0.000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  30.84 
 
 		 448 aa  71.6  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  38.79 
 
 		 442 aa  71.6  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  30.84 
 
 		 448 aa  71.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36 
 
 		 369 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>