260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1146 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1146  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
233 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017223  normal  0.0174129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5661  phosphoglycerate mutase  80 
 
 
234 aa  385  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  0.0883808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5033  phosphoglycerate mutase  68.67 
 
 
228 aa  298  4e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.533866  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5121  phosphoglycerate mutase  68.67 
 
 
228 aa  298  4e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.611067  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5414  phosphoglycerate mutase  68.67 
 
 
228 aa  298  4e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  0.969377 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13871  phosphoglycerate mutase  64.44 
 
 
232 aa  290  2e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0176  Phosphoglycerate mutase  49.12 
 
 
225 aa  180  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116131  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0146  Phosphoglycerate mutase  47.06 
 
 
211 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  41.18 
 
 
203 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3827  Phosphoglycerate mutase  35.19 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0219  Phosphoglycerate mutase  36.97 
 
 
238 aa  108  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4034  phosphoglycerate mutase  34.33 
 
 
223 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  37.02 
 
 
224 aa  106  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01160  fructose-2,6-bisphosphatase  35.44 
 
 
224 aa  99.4  4e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35690  fructose-2,6-bisphosphatase  35.47 
 
 
202 aa  96.7  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1972  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 
238 aa  72  0.000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0084  Phosphoglycerate mutase  35.16 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  33.71 
 
 
202 aa  68.2  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  30.16 
 
 
214 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5522  phosphoglycerate mutase  31.92 
 
 
231 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.351547 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5230  phosphoglycerate mutase  31.92 
 
 
231 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.696927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5141  phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 
259 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 
241 aa  62  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  30.34 
 
 
213 aa  61.6  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  27.84 
 
 
212 aa  61.6  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 
245 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  30.41 
 
 
209 aa  60.1  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  26.16 
 
 
207 aa  59.3  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  34.29 
 
 
218 aa  59.3  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13424  lipoprotein lpqD  25.24 
 
 
236 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.77779e-17  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1756  phosphoglycerate mutase-like protein  25.58 
 
 
219 aa  58.9  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.14183 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  34.09 
 
 
234 aa  59.3  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 
224 aa  58.9  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  23.88 
 
 
233 aa  58.5  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  30.34 
 
 
221 aa  58.5  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  26.86 
 
 
213 aa  58.5  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  28.98 
 
 
215 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  28.98 
 
 
215 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  34.3 
 
 
220 aa  58.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  31.8 
 
 
228 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1822  phosphoglycerate mutase  35.24 
 
 
210 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294943  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  32.79 
 
 
214 aa  58.2  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  28.41 
 
 
200 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  27.38 
 
 
209 aa  57.4  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  31.15 
 
 
235 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  26.59 
 
 
201 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  35.39 
 
 
199 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  26.59 
 
 
201 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  30.94 
 
 
445 aa  57  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3680  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 
186 aa  56.6  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  28.64 
 
 
204 aa  56.6  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3506  Phosphoglycerate mutase  35.43 
 
 
227 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  27.32 
 
 
218 aa  56.2  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  24.7 
 
 
204 aa  56.2  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  31.21 
 
 
209 aa  56.6  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.84 
 
 
200 aa  55.8  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.84 
 
 
200 aa  55.8  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  28.89 
 
 
212 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0578  phosphoglycerate mutase 1 family  32.58 
 
 
204 aa  55.8  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  28.89 
 
 
212 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0965  Phosphoglycerate mutase  32.95 
 
 
231 aa  55.8  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564706  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  25.24 
 
 
220 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  35.06 
 
 
402 aa  55.1  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  26.01 
 
 
208 aa  55.1  0.0000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 
207 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  25.86 
 
 
188 aa  55.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  33.85 
 
 
207 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  39.16 
 
 
391 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0120  phosphoglycerate mutase  31.05 
 
 
262 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.37 
 
 
442 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.35 
 
 
449 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02083  phosphoglycerate mutase family protein, putative  27.39 
 
 
259 aa  53.9  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.956321  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  27 
 
 
209 aa  54.3  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  26.14 
 
 
200 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  25.57 
 
 
212 aa  53.5  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  27.35 
 
 
223 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  26.5 
 
 
196 aa  53.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  32 
 
 
214 aa  53.1  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.33 
 
 
442 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  27.91 
 
 
227 aa  53.1  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3591  phosphoglyceromutase  28.36 
 
 
206 aa  53.1  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863261  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  30.11 
 
 
205 aa  53.1  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  23.79 
 
 
228 aa  52.8  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.65 
 
 
382 aa  52.8  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2434  phosphoglyceromutase  30.22 
 
 
212 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45200  predicted protein  28.19 
 
 
547 aa  52.8  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  28.38 
 
 
212 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  30.25 
 
 
240 aa  52.4  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1440  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.94 
 
 
209 aa  52  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1881  Phosphoglycerate mutase  28 
 
 
203 aa  52  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
230 aa  52  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.11 
 
 
444 aa  51.6  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  28.78 
 
 
232 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2506  phosphoglyceromutase  30.6 
 
 
212 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.428069  normal  0.0792311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2729  phosphoglyceromutase  30.6 
 
 
212 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.228083 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  30.22 
 
 
208 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  25.24 
 
 
220 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  26.17 
 
 
221 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  32.6 
 
 
198 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>