151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10768 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10768  PE-PGRS family protein  100 
 
 
584 aa  1114    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00003155  normal  0.917893 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5262  phosphoglycerate mutase  50.35 
 
 
421 aa  227  6e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4577  phosphoglycerate mutase  44.6 
 
 
443 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.296626 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3655  Phosphoglycerate mutase  43.8 
 
 
374 aa  167  5.9999999999999996e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5141  phosphoglycerate mutase  45.83 
 
 
259 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5522  phosphoglycerate mutase  46.3 
 
 
231 aa  151  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.351547 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5230  phosphoglycerate mutase  46.3 
 
 
231 aa  150  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.696927 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13424  lipoprotein lpqD  40.36 
 
 
236 aa  145  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.77779e-17  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4034  phosphoglycerate mutase  37.28 
 
 
223 aa  117  5e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3827  Phosphoglycerate mutase  37.17 
 
 
224 aa  116  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12540  PE family protein  43.01 
 
 
492 aa  108  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000611241  hitchhiker  0.0026092 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12868  PE-PGRS family protein  42.86 
 
 
663 aa  107  6e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00218222  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01160  fructose-2,6-bisphosphatase  35.02 
 
 
224 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12513  PE-PGRS family protein  46.2 
 
 
272 aa  103  8e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.7912e-70  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  38.99 
 
 
224 aa  103  9e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11480  PE-PGRS family protein  43.51 
 
 
737 aa  99.8  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.94455e-50  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11796  PE-PGRS family protein  47.5 
 
 
618 aa  99  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000152846 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12014  PE-PGRS family protein  45.45 
 
 
558 aa  97.8  5e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10995  PE-PGRS family protein  40 
 
 
923 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  5.02084e-24  normal  0.770391 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13403  PE-PGRS family protein  47.51 
 
 
591 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000216419  normal  0.654566 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11478  PE-PGRS family protein  44.81 
 
 
1407 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000217058  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12611  PE-PGRS family protein  40.66 
 
 
543 aa  94.4  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0987331  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13628  PE-PGRS family protein  44.44 
 
 
439 aa  92  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000236295  normal  0.0644121 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11086  PE-PGRS family protein  41.21 
 
 
463 aa  90.5  8e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.21582e-33  normal  0.255 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12424  PE-PGRS family protein  43.31 
 
 
382 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.712465  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11085  PE-PGRS family protein  44.85 
 
 
667 aa  88.2  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.21525e-28  normal  0.25323 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11357  PE-PGRS family protein  43.95 
 
 
603 aa  87  8e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0271727  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13422  PE-PGRS family protein  43.59 
 
 
731 aa  86.7  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000255336  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13545  PE-PGRS family protein  41.61 
 
 
1888 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000435663  hitchhiker  0.000141751 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13623  PE-PGRS family protein  48.41 
 
 
584 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.91824e-18  normal  0.0516609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11469  PE-PGRS family protein  43.75 
 
 
491 aa  85.5  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0503304  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13114  hypothetical protein  46.15 
 
 
437 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.773081 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13378  PE-PGRS family protein  45.86 
 
 
1570 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.793451  normal  0.887646 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11496  PE-PGRS family protein  45.51 
 
 
375 aa  84  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000634061  normal  0.0755488 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35690  fructose-2,6-bisphosphatase  32.87 
 
 
202 aa  83.6  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12509  PE-PGRS family protein  50.62 
 
 
431 aa  81.6  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.90533e-20  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10996  PE-PGRS family protein  45.22 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.7191000000000003e-35  normal  0.547752 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0219  Phosphoglycerate mutase  35.05 
 
 
238 aa  80.9  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12653  PE-PGRS family protein  47.5 
 
 
788 aa  80.9  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000028408  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10110  PE-PGRS family protein  42.26 
 
 
533 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11848  PE-PGRS family protein  46.88 
 
 
518 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.114393  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  31.6 
 
 
203 aa  79  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10161  PE family protein  46.28 
 
 
502 aa  78.2  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00736493  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11269  PE-PGRS family protein  43.59 
 
 
414 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119088  hitchhiker  0.00152162 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10588  PE-PGRS family protein  42.24 
 
 
1306 aa  77  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00297042  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10152  PE family protein  57.5 
 
 
588 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10849  PE-PGRS family protein  58.97 
 
 
879 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.4370299999999996e-27  hitchhiker  0.00000147431 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10998  PE-PGRS family protein  43.12 
 
 
457 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000104383  normal  0.995085 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12754  PE-PGRS family protein  42.86 
 
 
565 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000417196  normal  0.0386161 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13542  PE-PGRS family protein  40.99 
 
 
2332 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000034434  hitchhiker  0.00332748 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13547  PE-PGRS family protein  40.99 
 
 
1086 aa  76.3  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.98986e-36  hitchhiker  0.0000786536 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12634  PE-PGRS family protein  43.12 
 
 
461 aa  75.1  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000268791  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12192  PE-PGRS family protein  41.24 
 
 
532 aa  73.9  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.9578499999999997e-20  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10125  PE-PGRS family protein  46.5 
 
 
561 aa  73.9  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00000000011228  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12351  PE family protein  49.48 
 
 
382 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11818  PE family protein  62.07 
 
 
99 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.850225  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11868  PE-PGRS family protein  66.67 
 
 
515 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000473061  normal  0.517398 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13512  PE family protein  54.22 
 
 
98 aa  72  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.951509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11663  PE family protein  35.98 
 
 
310 aa  71.6  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11112  PE-PGRS family protein  43.31 
 
 
853 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336586  normal  0.286221 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11669  PE-PGRS family protein  39.51 
 
 
549 aa  68.2  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  8.43838e-17  normal  0.300456 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10160  PE family protein  56.41 
 
 
468 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11197  PE family protein  60 
 
 
308 aa  67  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11821  PE family protein  60.92 
 
 
105 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.784266  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10285  PE-PGRS family protein  60.98 
 
 
906 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.9295399999999998e-51  normal  0.572415 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10847  PE-PGRS family protein  41.4 
 
 
137 aa  65.1  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.4239e-69  hitchhiker  0.000000132499 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11425  PE-PGRS family protein  40.51 
 
 
576 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000100458  normal  0.0951709 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12364  PE-PGRS family protein  56.25 
 
 
413 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13871  phosphoglycerate mutase  28.97 
 
 
232 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2210  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  43.82 
 
 
191 aa  63.2  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10286  PE-PGRS family protein  59.76 
 
 
837 aa  62  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.18338e-28  normal  0.53963 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  28.64 
 
 
223 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10284  PE-PGRS family protein  58.54 
 
 
372 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.00543e-83  normal  0.307797 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10934  PE family protein  46.75 
 
 
99 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11459  PE family protein  57.14 
 
 
528 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13846  PE-PGRS family protein  50.55 
 
 
504 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200621  normal  0.262827 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11836  PE family protein  53.85 
 
 
99 aa  57  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0146  Phosphoglycerate mutase  29.68 
 
 
211 aa  56.6  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  38.95 
 
 
212 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11058  PE family protein  52.75 
 
 
275 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.986731 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11194  PE family protein  36.96 
 
 
106 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12782  PE family protein  48.86 
 
 
275 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.45258  normal  0.270609 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13541  PE-PGRS family protein  43.15 
 
 
1403 aa  56.2  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.3382500000000002e-18  hitchhiker  0.000118269 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12459  PE family protein  38.46 
 
 
99 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.585333 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 
209 aa  54.3  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5661  phosphoglycerate mutase  27.68 
 
 
234 aa  54.3  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  0.0883808 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0176  Phosphoglycerate mutase  35.96 
 
 
225 aa  54.3  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116131  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13653  PE family protein  45.98 
 
 
99 aa  54.3  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0152318  hitchhiker  0.000345273 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  36.67 
 
 
220 aa  53.5  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3949  Phosphoglycerate mutase  40 
 
 
232 aa  53.5  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00773926  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  36.96 
 
 
220 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  36.26 
 
 
213 aa  53.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1146  phosphoglycerate mutase  27.96 
 
 
233 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017223  normal  0.0174129 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  38.2 
 
 
215 aa  52  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  38.2 
 
 
215 aa  52  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  38.2 
 
 
215 aa  52  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  38.04 
 
 
220 aa  52  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10304  PE-PGRS family protein  42.5 
 
 
622 aa  52  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0360601  normal  0.165119 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11238  PE family protein  63.24 
 
 
110 aa  52  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000499938  normal  0.0437659 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10756  PE-PGRS family protein  61.54 
 
 
172 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.95619e-19  normal  0.324596 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>