94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13424 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13424  lipoprotein lpqD  100 
 
 		 236 aa  485  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.77779e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5141  phosphoglycerate mutase  49.49 
 
 		 259 aa  188  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5522  phosphoglycerate mutase  49.49 
 
 		 231 aa  188  7e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.351547 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5230  phosphoglycerate mutase  49.49 
 
 		 231 aa  188  8e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.696927 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5262  phosphoglycerate mutase  46.04 
 
 		 421 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4577  phosphoglycerate mutase  38.2 
 
 		 443 aa  149  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.296626 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3655  Phosphoglycerate mutase  36.51 
 
 		 374 aa  139  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10768  PE-PGRS family protein  40.74 
 
 		 584 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00003155  normal  0.917893 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3827  Phosphoglycerate mutase  31.5 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  31.84 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4034  phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 		 223 aa  102  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01160  fructose-2,6-bisphosphatase  30.96 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0219  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  28.22 
 
 		 203 aa  89.7  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35690  fructose-2,6-bisphosphatase  30.65 
 
 		 202 aa  82.4  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0146  Phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  25.75 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  25.75 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1146  phosphoglycerate mutase  25.24 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017223  normal  0.0174129 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  27.33 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  25.75 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  23.08 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  32.61 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3521  Phosphoglycerate mutase  29.67 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5033  phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.533866  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5917  phosphoglycerate mutase  25.53 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5661  phosphoglycerate mutase  25.48 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  0.0883808 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13871  phosphoglycerate mutase  26.21 
 
 		 232 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5121  phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.611067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  29.88 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0773  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 205 aa  51.2  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.880145  normal  0.0308619 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5414  phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  0.969377 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  24.86 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  36.96 
 
 		 201 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0704  phosphoglycerate mutase  30.84 
 
 		 202 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336506  normal  0.0665622 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0691  phosphoglycerate mutase  30.84 
 
 		 202 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.901164  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0684  phosphoglycerate mutase  30.84 
 
 		 202 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  30.07 
 
 		 220 aa  48.5  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1035  Phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 		 208 aa  48.5  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784074  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  28.4 
 
 		 221 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8083  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  28.4 
 
 		 221 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4519  phosphoglycerate mutase  34.04 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.970901  decreased coverage  0.000692591 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  27.54 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2908  Phosphoglycerate mutase  28.21 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  25.15 
 
 		 201 aa  47.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  25.15 
 
 		 201 aa  47.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4099  phosphoglycerate mutase  31.91 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  30.07 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  27.54 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  30.53 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0571  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  36.51 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0176  Phosphoglycerate mutase  24.68 
 
 		 225 aa  46.2  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116131  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0327  phosphoglycerate mutase  28.93 
 
 		 389 aa  45.8  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0688  Phosphoglycerate mutase  28.97 
 
 		 209 aa  46.2  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3255  Phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 		 215 aa  45.8  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122259  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4432  Phosphoglycerate mutase  38.1 
 
 		 223 aa  45.4  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02129  hypothetical protein  31.16 
 
 		 204 aa  45.4  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  26.06 
 
 		 214 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  27.54 
 
 		 220 aa  45.4  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  27.78 
 
 		 224 aa  45.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  26.4 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0344  Phosphoglycerate mutase  33.72 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0268  phosphoglycerate mutase  32.47 
 
 		 230 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 		 200 aa  44.3  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3949  Phosphoglycerate mutase  25.13 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00773926  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.17 
 
 		 442 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  28.97 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  29.67 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  25.3 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 		 204 aa  42.7  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.49 
 
 		 442 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0055  Phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 216 aa  42.7  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0249484  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0587  Phosphoglycerate mutase  26.09 
 
 		 183 aa  42.7  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 		 212 aa  42.7  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  27.87 
 
 		 218 aa  42.7  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3338  phosphoglycerate mutase  25.45 
 
 		 235 aa  42.7  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000263066  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2439  Phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 		 261 aa  42.7  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  24.82 
 
 		 215 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  23.7 
 
 		 230 aa  42.4  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24360  fructose-2,6-bisphosphatase  32.43 
 
 		 258 aa  42.7  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  23.72 
 
 		 209 aa  42.4  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4800  phosphoglycerate mutase  24.07 
 
 		 225 aa  42.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.593362 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  24.82 
 
 		 215 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  29.31 
 
 		 223 aa  42  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4574  Phosphoglycerate mutase  34.92 
 
 		 211 aa  42.4  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  25.84 
 
 		 234 aa  42  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6122  phosphoglycerate mutase  24.68 
 
 		 214 aa  42  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.756023  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.49 
 
 		 442 aa  42  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  28.41 
 
 		 207 aa  42  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07190  fructose-2,6-bisphosphatase  31.53 
 
 		 214 aa  41.6  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.239476 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  34.38 
 
 		 204 aa  41.6  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>