126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0828 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0828  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 215 aa  439  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4099  phosphoglycerate mutase  66.82 
 
 		 217 aa  283  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4519  phosphoglycerate mutase  65.7 
 
 		 218 aa  266  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.970901  decreased coverage  0.000692591 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02930  fructose-2,6-bisphosphatase  66.33 
 
 		 212 aa  263  1e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0740829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6718  Phosphoglycerate mutase  64.68 
 
 		 209 aa  262  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10536  hypothetical protein  64.82 
 
 		 202 aa  259  3e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.443831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0688  Phosphoglycerate mutase  62.81 
 
 		 209 aa  258  4e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0250  phosphoglycerate mutase  61.42 
 
 		 208 aa  248  4e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0500  phosphoglycerate mutase  59 
 
 		 226 aa  245  4e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4574  Phosphoglycerate mutase  61.46 
 
 		 211 aa  244  4.9999999999999997e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0053  phosphoglycerate mutase  62.76 
 
 		 211 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0571  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  58.91 
 
 		 212 aa  243  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24360  fructose-2,6-bisphosphatase  60.09 
 
 		 258 aa  241  5e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4432  Phosphoglycerate mutase  61.39 
 
 		 223 aa  240  1e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0865  phosphoglycerate mutase  62.31 
 
 		 200 aa  239  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234794  normal  0.0164248 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0268  phosphoglycerate mutase  54.5 
 
 		 230 aa  238  5e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2735  Phosphoglycerate mutase  58.8 
 
 		 218 aa  238  6.999999999999999e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0193457  normal  0.0536563 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07190  fructose-2,6-bisphosphatase  56.6 
 
 		 214 aa  238  6.999999999999999e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.239476 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0520  Phosphoglycerate mutase  58.49 
 
 		 214 aa  238  6.999999999999999e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000239423  hitchhiker  0.0030249 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1035  Phosphoglycerate mutase  60.61 
 
 		 208 aa  237  8e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784074  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0691  phosphoglycerate mutase  60.91 
 
 		 202 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.901164  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0704  phosphoglycerate mutase  60.91 
 
 		 202 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336506  normal  0.0665622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0684  phosphoglycerate mutase  60.91 
 
 		 202 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314274  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2725  putative phosphoglycerate mutase  53.17 
 
 		 211 aa  226  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.639263  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0925  Phosphoglycerate mutase  54.72 
 
 		 229 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8083  Phosphoglycerate mutase  56.59 
 
 		 217 aa  222  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0443  Phosphoglycerate mutase  55.66 
 
 		 216 aa  221  4.9999999999999996e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354307  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0627  Phosphoglycerate mutase  52.88 
 
 		 214 aa  219  3e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.653662  normal  0.0164182 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4358  Phosphoglycerate mutase  53.66 
 
 		 211 aa  218  6e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3255  Phosphoglycerate mutase  52.53 
 
 		 215 aa  210  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122259  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3293  phosphoglycerate mutase  53.24 
 
 		 221 aa  206  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3092  Phosphoglycerate mutase  51.8 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24270  fructose-2,6-bisphosphatase  53.11 
 
 		 215 aa  204  7e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.110753  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6122  phosphoglycerate mutase  51.27 
 
 		 214 aa  201  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.756023  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0508  phosphoglycerate mutase  53.85 
 
 		 215 aa  195  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.66686 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17980  fructose-2,6-bisphosphatase  48.62 
 
 		 224 aa  181  8.000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0199  phosphoglycerate mutase family protein  37.22 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1266  phosphoglycerate mutase family protein  38.6 
 
 		 219 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0344  Phosphoglycerate mutase  32.02 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  36.94 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.87 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  31.06 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  38.68 
 
 		 273 aa  55.1  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.71 
 
 		 356 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  34.18 
 
 		 363 aa  52  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  32.89 
 
 		 200 aa  51.6  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  32.3 
 
 		 383 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0773  phosphoglycerate mutase  28.21 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.880145  normal  0.0308619 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1760  phosphoglycerate mutase family protein  31.69 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000115709  normal  0.449804 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 		 253 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  35.06 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3452  phosphoglycerate mutase  32.73 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  43.28 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  27.68 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  27.68 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  27.68 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  27.68 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  27.68 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  27.68 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  27.68 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  27.68 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  27.13 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  27.13 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  27.13 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0055  Phosphoglycerate mutase  27.16 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0249484  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  25.81 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  39.73 
 
 		 224 aa  48.1  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  27.17 
 
 		 215 aa  48.1  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  31.33 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 215 aa  48.1  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  29.23 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  29.23 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  32.03 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  37.93 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  39.74 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  26.73 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  28.1 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  27.44 
 
 		 198 aa  46.6  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  32.5 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0327  phosphoglycerate mutase  33.71 
 
 		 389 aa  45.8  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 391 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  30.32 
 
 		 221 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.67 
 
 		 365 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  30.32 
 
 		 221 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.67 
 
 		 365 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.67 
 
 		 365 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  29.68 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5262  phosphoglycerate mutase  32.63 
 
 		 421 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  26.77 
 
 		 203 aa  45.4  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 199 aa  45.4  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  34.34 
 
 		 208 aa  45.1  0.0008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  29.86 
 
 		 229 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01160  fructose-2,6-bisphosphatase  34.58 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  25.84 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  40.91 
 
 		 274 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  26.29 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  26.29 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  26.29 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>