275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5230 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5141  phosphoglycerate mutase  99.57 
 
 
259 aa  460  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5230  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
231 aa  461  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.696927 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5522  phosphoglycerate mutase  99.57 
 
 
231 aa  460  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.351547 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13424  lipoprotein lpqD  49.28 
 
 
236 aa  209  2e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.77779e-17  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4577  phosphoglycerate mutase  48.91 
 
 
443 aa  201  8e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.296626 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5262  phosphoglycerate mutase  53.96 
 
 
421 aa  196  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10768  PE-PGRS family protein  46.3 
 
 
584 aa  156  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00003155  normal  0.917893 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3655  Phosphoglycerate mutase  42.13 
 
 
374 aa  151  7e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3827  Phosphoglycerate mutase  40.89 
 
 
224 aa  145  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  43.78 
 
 
224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4034  phosphoglycerate mutase  39.81 
 
 
223 aa  135  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0219  Phosphoglycerate mutase  39.81 
 
 
238 aa  123  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01160  fructose-2,6-bisphosphatase  35.82 
 
 
224 aa  122  6e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35690  fructose-2,6-bisphosphatase  38.5 
 
 
202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0146  Phosphoglycerate mutase  38.92 
 
 
211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  35.5 
 
 
203 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1146  phosphoglycerate mutase  32.23 
 
 
233 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017223  normal  0.0174129 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5661  phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 
234 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  0.0883808 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  31.29 
 
 
233 aa  72.8  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13871  phosphoglycerate mutase  32.37 
 
 
232 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5033  phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.533866  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5121  phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.611067  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5414  phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  0.969377 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0587  Phosphoglycerate mutase  36.6 
 
 
183 aa  68.2  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  28.26 
 
 
208 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0176  Phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 
225 aa  62  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.116131  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  32.28 
 
 
229 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6122  phosphoglycerate mutase  40 
 
 
214 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.756023  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  36.44 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  28.29 
 
 
228 aa  59.7  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  25.71 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  25.71 
 
 
212 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  27.06 
 
 
212 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2210  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35 
 
 
191 aa  58.9  0.00000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1756  phosphoglycerate mutase-like protein  25.81 
 
 
219 aa  58.9  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.14183 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  28 
 
 
213 aa  58.5  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  35.59 
 
 
221 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  35.59 
 
 
221 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21080  fructose-2,6-bisphosphatase  36.08 
 
 
197 aa  57.4  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  30.21 
 
 
221 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2062  phosphoglycerate mutase  36.11 
 
 
229 aa  57.4  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.792733 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.88 
 
 
442 aa  57  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0116  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 
221 aa  57.4  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128968  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25 
 
 
442 aa  57  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  31.67 
 
 
237 aa  56.6  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  34.75 
 
 
220 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  31.65 
 
 
224 aa  56.6  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  30.12 
 
 
220 aa  55.8  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  39.6 
 
 
391 aa  55.8  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  39.77 
 
 
194 aa  55.5  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  37.82 
 
 
226 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  37.82 
 
 
226 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2908  Phosphoglycerate mutase  27.17 
 
 
219 aa  55.5  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  32.74 
 
 
223 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  26.51 
 
 
214 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3521  Phosphoglycerate mutase  37.36 
 
 
228 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  34.41 
 
 
242 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  27.03 
 
 
210 aa  53.9  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0084  Phosphoglycerate mutase  28.74 
 
 
207 aa  54.3  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  28.19 
 
 
221 aa  53.9  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  33.9 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  31.75 
 
 
220 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  31.75 
 
 
220 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3949  Phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 
232 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00773926  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  26.04 
 
 
212 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  23.64 
 
 
206 aa  54.3  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  31.22 
 
 
229 aa  53.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  28.17 
 
 
447 aa  52.8  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  31.75 
 
 
229 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  30.84 
 
 
225 aa  52.8  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1035  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
208 aa  53.1  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784074  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.61 
 
 
442 aa  52.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  30.09 
 
 
223 aa  52.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2439  Phosphoglycerate mutase  35.64 
 
 
261 aa  52.8  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.777666  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  31.05 
 
 
226 aa  52.4  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0069  broad-specificity phosphatase PhoE  37.78 
 
 
197 aa  52.4  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  32 
 
 
192 aa  52.4  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  31.75 
 
 
220 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  31.75 
 
 
220 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  31.75 
 
 
220 aa  52.4  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0567  phosphoglycerate mutase  28.85 
 
 
216 aa  52  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.350185  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0055  Phosphoglycerate mutase  23.35 
 
 
216 aa  52  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0249484  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  33.97 
 
 
199 aa  52  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1052  phosphoglyceromutase  37.23 
 
 
206 aa  52  0.000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.121789  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  28.64 
 
 
230 aa  52  0.000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2672  phosphoglycerate mutase  41.67 
 
 
176 aa  52  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1881  Phosphoglycerate mutase  25.79 
 
 
203 aa  51.6  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1844  phosphoglycerate mutase  28.74 
 
 
226 aa  52  0.000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000187954  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  30.63 
 
 
221 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  30.92 
 
 
194 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3778  phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 
207 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1087  Phosphoglycerate mutase  32.69 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  25 
 
 
203 aa  50.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  25.95 
 
 
217 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  27.22 
 
 
212 aa  50.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  23.7 
 
 
212 aa  50.8  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  31.47 
 
 
411 aa  50.4  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>