251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0865 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0865  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
200 aa  414  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.234794  normal  0.0164248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0053  phosphoglycerate mutase  87.94 
 
 
211 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0595129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0691  phosphoglycerate mutase  79.9 
 
 
202 aa  333  9e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.901164  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0704  phosphoglycerate mutase  79.9 
 
 
202 aa  333  9e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.336506  normal  0.0665622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0684  phosphoglycerate mutase  79.9 
 
 
202 aa  333  9e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314274  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0688  Phosphoglycerate mutase  63.64 
 
 
209 aa  241  3.9999999999999997e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0887633  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4099  phosphoglycerate mutase  62.94 
 
 
217 aa  233  9e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.459871 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0250  phosphoglycerate mutase  57.29 
 
 
208 aa  232  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12987  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0828  Phosphoglycerate mutase  62.94 
 
 
215 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0571  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  56.85 
 
 
212 aa  225  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.149991  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1035  Phosphoglycerate mutase  60.3 
 
 
208 aa  224  7e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.784074  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4574  Phosphoglycerate mutase  61.42 
 
 
211 aa  224  7e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02930  fructose-2,6-bisphosphatase  59.6 
 
 
212 aa  223  1e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0740829  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10536  hypothetical protein  63.96 
 
 
202 aa  222  3e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.443831  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4519  phosphoglycerate mutase  60.21 
 
 
218 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.970901  decreased coverage  0.000692591 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6718  Phosphoglycerate mutase  57.58 
 
 
209 aa  219  3e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0268  phosphoglycerate mutase  55.33 
 
 
230 aa  219  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  0.887573 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4432  Phosphoglycerate mutase  59.39 
 
 
223 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0500  phosphoglycerate mutase  55.33 
 
 
226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07190  fructose-2,6-bisphosphatase  56.78 
 
 
214 aa  211  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.239476 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24360  fructose-2,6-bisphosphatase  60.41 
 
 
258 aa  211  5.999999999999999e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2735  Phosphoglycerate mutase  57.84 
 
 
218 aa  210  9e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0193457  normal  0.0536563 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0520  Phosphoglycerate mutase  57.65 
 
 
214 aa  207  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000000239423  hitchhiker  0.0030249 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2725  putative phosphoglycerate mutase  52.79 
 
 
211 aa  206  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.639263  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8083  Phosphoglycerate mutase  56.35 
 
 
217 aa  202  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0443  Phosphoglycerate mutase  54.23 
 
 
216 aa  201  5e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.354307  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0627  Phosphoglycerate mutase  52.28 
 
 
214 aa  201  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.653662  normal  0.0164182 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4358  Phosphoglycerate mutase  51.27 
 
 
211 aa  193  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6122  phosphoglycerate mutase  52.28 
 
 
214 aa  191  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.756023  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0925  Phosphoglycerate mutase  50.77 
 
 
229 aa  188  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24270  fructose-2,6-bisphosphatase  55.61 
 
 
215 aa  188  5e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.110753  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0508  phosphoglycerate mutase  55.84 
 
 
215 aa  188  5e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.409305  normal  0.66686 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3255  Phosphoglycerate mutase  52.22 
 
 
215 aa  184  7e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.122259  normal  0.209193 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3293  phosphoglycerate mutase  48.24 
 
 
221 aa  173  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3092  Phosphoglycerate mutase  45.54 
 
 
226 aa  164  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17980  fructose-2,6-bisphosphatase  49.51 
 
 
224 aa  162  3e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1266  phosphoglycerate mutase family protein  37.5 
 
 
219 aa  122  5e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0199  phosphoglycerate mutase family protein  36.23 
 
 
230 aa  117  9.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0344  Phosphoglycerate mutase  31.34 
 
 
219 aa  89.4  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.16 
 
 
369 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1313  phosphoglycerate mutase  38.16 
 
 
200 aa  68.2  0.00000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.46 
 
 
356 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  32.66 
 
 
240 aa  67  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 
440 aa  63.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  32.76 
 
 
204 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1169  phosphoglycerate mutase  41.98 
 
 
224 aa  62.8  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3452  phosphoglycerate mutase  33.92 
 
 
200 aa  61.6  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  28.57 
 
 
222 aa  61.2  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
222 aa  61.2  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
201 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 
215 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  34.84 
 
 
207 aa  60.1  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  46.43 
 
 
235 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0267  Phosphoglycerate mutase  29.7 
 
 
232 aa  59.3  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0998048 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
207 aa  59.3  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 
401 aa  58.9  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  32 
 
 
214 aa  58.2  0.00000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  33.73 
 
 
363 aa  58.2  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  31.47 
 
 
383 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.39 
 
 
365 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.39 
 
 
365 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.39 
 
 
365 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  30 
 
 
402 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2210  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  43.59 
 
 
191 aa  57  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  25.65 
 
 
206 aa  57  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  27.45 
 
 
215 aa  56.2  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  32.82 
 
 
391 aa  54.7  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 
226 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 
226 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 
226 aa  54.7  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  29.9 
 
 
215 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13280  fructose-2,6-bisphosphatase  41.56 
 
 
208 aa  54.3  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  26.42 
 
 
370 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  35.04 
 
 
223 aa  54.3  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  33.86 
 
 
194 aa  54.3  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  29.31 
 
 
201 aa  53.9  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  27.32 
 
 
213 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  26.09 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  29.31 
 
 
201 aa  53.9  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36168  predicted protein  31.77 
 
 
340 aa  52.8  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 
207 aa  53.1  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  25.85 
 
 
209 aa  52.8  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  38.75 
 
 
221 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  35.37 
 
 
224 aa  52.4  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  30.63 
 
 
412 aa  52.4  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2115  phosphoglycerate mutase  39.01 
 
 
199 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0120196 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 
273 aa  52  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  26.47 
 
 
412 aa  52  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0245  phosphoglycerate mutase  44.19 
 
 
220 aa  52  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.044549 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
208 aa  51.6  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2007  Phosphoglycerate mutase  37.35 
 
 
199 aa  51.6  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00274439  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0290  phosphoglycerate mutase  43.02 
 
 
220 aa  51.2  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.438239  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  45.59 
 
 
274 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 
215 aa  50.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  27.27 
 
 
207 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  38.27 
 
 
233 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 
215 aa  50.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 
215 aa  50.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.83 
 
 
382 aa  50.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  27.43 
 
 
200 aa  50.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>