More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_14960 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  100 
 
 		 243 aa  473  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  51.82 
 
 		 412 aa  218  8.999999999999998e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  42.08 
 
 		 366 aa  128  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  37.62 
 
 		 401 aa  123  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  36.23 
 
 		 427 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 		 411 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  36.27 
 
 		 402 aa  111  8.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  37.75 
 
 		 440 aa  108  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  36.45 
 
 		 412 aa  107  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  34.87 
 
 		 222 aa  105  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  34.87 
 
 		 222 aa  105  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  33.98 
 
 		 383 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.84 
 
 		 378 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  32.77 
 
 		 378 aa  99.8  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.01 
 
 		 369 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.5 
 
 		 356 aa  99  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  35.64 
 
 		 452 aa  97.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  31.78 
 
 		 370 aa  96.3  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  35.15 
 
 		 363 aa  95.9  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  34.47 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.32 
 
 		 378 aa  92.4  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  33.82 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  26.88 
 
 		 208 aa  89.4  5e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 		 212 aa  88.6  9e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.88 
 
 		 365 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.88 
 
 		 365 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.88 
 
 		 365 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  26.8 
 
 		 201 aa  87.4  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2273  Phosphoglycerate mutase  45.13 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000488437  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  26.8 
 
 		 201 aa  87.4  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  35.42 
 
 		 241 aa  85.1  9e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 208 aa  85.1  9e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  34.67 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  38.52 
 
 		 198 aa  84.7  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  26.56 
 
 		 196 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  38.2 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.98 
 
 		 364 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3671  phosphoglycerate mutase  31.5 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.786994  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  38.2 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  34.31 
 
 		 274 aa  82  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  36.04 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  27.23 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  31.79 
 
 		 214 aa  80.9  0.00000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1955  phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00415213  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  28.57 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  32.99 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  35.05 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  29.8 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  34.03 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  31.12 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2645  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 275 aa  79.3  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13165  normal  0.0421048 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2137  Phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  32.99 
 
 		 233 aa  77.8  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.75 
 
 		 201 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2761  Phosphoglycerate mutase  30.14 
 
 		 273 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2693  phosphoglycerate mutase  30.1 
 
 		 206 aa  78.6  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  30.19 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  32.65 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  32.65 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  32.67 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  32.65 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  36.1 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0327  phosphoglycerate mutase  36.27 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_002950  PG1513  phosphoribosyltransferase, putative/phosphoglycerate mutase family protein  29.44 
 
 		 438 aa  76.6  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000537342 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  24.21 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  33 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  33.83 
 
 		 391 aa  75.9  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  29.06 
 
 		 448 aa  75.5  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  32.82 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  30.41 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12165  hypothetical protein  31.31 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 448 aa  74.7  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  35.63 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  32.81 
 
 		 245 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  34.69 
 
 		 235 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  30.53 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  32.64 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  29.71 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.17 
 
 		 442 aa  73.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  27.54 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  32.83 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  31.98 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  37.23 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  34.86 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  29.95 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.17 
 
 		 442 aa  72  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2776  Phosphoglycerate mutase  32.64 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787137  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1833  Phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 		 245 aa  71.6  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.5 
 
 		 200 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  29.69 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  31.25 
 
 		 203 aa  71.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  32.38 
 
 		 205 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  32.65 
 
 		 207 aa  71.6  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>