More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2710 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 215 aa  427  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  66.51 
 
 		 369 aa  271  5.000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  66.2 
 
 		 356 aa  270  8.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  67.94 
 
 		 365 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  67.94 
 
 		 365 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  67.94 
 
 		 365 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  62.98 
 
 		 391 aa  235  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  61.5 
 
 		 364 aa  226  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  59.72 
 
 		 383 aa  225  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  60.09 
 
 		 218 aa  220  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  53.66 
 
 		 378 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  50.48 
 
 		 378 aa  190  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 378 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  52.76 
 
 		 440 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  48.6 
 
 		 427 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  49.04 
 
 		 382 aa  171  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  46.04 
 
 		 402 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  50 
 
 		 452 aa  161  8.000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  47.03 
 
 		 412 aa  157  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  44 
 
 		 411 aa  150  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  47.18 
 
 		 363 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  41.79 
 
 		 401 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  38.94 
 
 		 205 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  35.36 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  35.15 
 
 		 370 aa  112  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 211 aa  108  6e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  32.14 
 
 		 200 aa  108  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  32.14 
 
 		 200 aa  108  7.000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  38.38 
 
 		 366 aa  105  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  31.63 
 
 		 200 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  32.65 
 
 		 200 aa  103  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  35.1 
 
 		 253 aa  101  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  33.82 
 
 		 243 aa  100  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  39.9 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  36.87 
 
 		 212 aa  99.8  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 		 208 aa  98.6  6e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 209 aa  98.2  8e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 		 222 aa  96.3  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  42.86 
 
 		 222 aa  96.3  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  35.32 
 
 		 209 aa  96.3  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  31.72 
 
 		 196 aa  96.7  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  32.31 
 
 		 213 aa  95.5  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  38.51 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1556  Phosphoglycerate mutase  39.39 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.063536  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  34.9 
 
 		 412 aa  92.4  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  33 
 
 		 209 aa  91.7  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.44 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  33.5 
 
 		 205 aa  91.3  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  30.35 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  35.42 
 
 		 227 aa  90.5  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  36.41 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13280  fructose-2,6-bisphosphatase  43.14 
 
 		 208 aa  89  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.5 
 
 		 442 aa  89  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  40.65 
 
 		 195 aa  89  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  34.41 
 
 		 241 aa  88.6  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  33.5 
 
 		 202 aa  86.7  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  33.5 
 
 		 213 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0238  phosphoglycerate mutase  31 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.688849  normal  0.278174 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  40.54 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  33.87 
 
 		 245 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  37.63 
 
 		 205 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  33.5 
 
 		 202 aa  86.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.76 
 
 		 442 aa  86.3  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  32.26 
 
 		 213 aa  86.3  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  34.17 
 
 		 207 aa  86.7  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  31.98 
 
 		 203 aa  86.7  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.02 
 
 		 212 aa  85.9  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  30.77 
 
 		 200 aa  85.9  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  34.92 
 
 		 227 aa  85.5  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  35.5 
 
 		 198 aa  85.5  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  33.5 
 
 		 202 aa  85.5  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 215 aa  85.1  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  40.82 
 
 		 198 aa  85.1  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  33.5 
 
 		 202 aa  85.1  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  31.47 
 
 		 203 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3671  phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 		 207 aa  85.1  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.786994  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  35.57 
 
 		 205 aa  85.1  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  31.47 
 
 		 203 aa  85.1  8e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  31.47 
 
 		 203 aa  84.7  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  40.49 
 
 		 205 aa  84.7  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.47 
 
 		 203 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  31.47 
 
 		 203 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  31.47 
 
 		 203 aa  84.7  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  37.27 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  32.8 
 
 		 217 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  31.47 
 
 		 203 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  32.48 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.84 
 
 		 442 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  36.65 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  41.14 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  32.48 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  37.65 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.57 
 
 		 442 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  27.72 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  36.88 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  27.78 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>