295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02083 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02083  phosphoglycerate mutase family protein, putative  100 
 
 
259 aa  525  1e-148  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.956321  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0181  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  52.59 
 
 
266 aa  245  4e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0743  phosphoglycerate mutase  53.09 
 
 
252 aa  242  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702644  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3699  Phosphoglycerate mutase  42.74 
 
 
253 aa  194  1e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155498  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0120  phosphoglycerate mutase  43.78 
 
 
262 aa  183  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1588  Phosphoglycerate mutase  44.75 
 
 
234 aa  178  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3036  Phosphoglycerate mutase  42.99 
 
 
258 aa  171  9e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.943102 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1302  Phosphoglycerate mutase  44.55 
 
 
245 aa  160  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106982  decreased coverage  0.000409559 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1986  Phosphoglycerate mutase  42.72 
 
 
244 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000793068  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9413  hypothetical protein  40.85 
 
 
242 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4997  Phosphoglycerate mutase  37.96 
 
 
238 aa  109  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118057  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1988  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
249 aa  79  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  39.13 
 
 
412 aa  76.3  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2199  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
249 aa  75.5  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0611897 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0651  phosphoglycerate mutase family protein  27.23 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3680  phosphoglycerate mutase  35.34 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10844  hypothetical protein similar to fructose-2,6-bisphosphatase (Eurofung)  29.84 
 
 
443 aa  64.7  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  27.95 
 
 
212 aa  65.1  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  32.79 
 
 
383 aa  63.5  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  28.37 
 
 
226 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 
256 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3452  phosphoglycerate mutase  30.19 
 
 
200 aa  63.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 
224 aa  63.2  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  30.43 
 
 
205 aa  62.8  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  30.56 
 
 
223 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1751  phosphoglycerate mutase  31.34 
 
 
189 aa  62.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0730001  normal  0.102833 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3506  Phosphoglycerate mutase  32.95 
 
 
227 aa  62.4  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  27.91 
 
 
226 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68318  fructose-2,6-bisphosphatase (FBP26)  29.67 
 
 
456 aa  62.4  0.000000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.995791  normal  0.428172 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.22 
 
 
378 aa  62.4  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  28.86 
 
 
224 aa  62.4  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13280  fructose-2,6-bisphosphatase  35.51 
 
 
208 aa  62.4  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  33.91 
 
 
229 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  31.28 
 
 
229 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6372  phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 
268 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0608  Phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 
217 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  30.27 
 
 
230 aa  61.2  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_6517  predicted protein  29.68 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.454064  normal  0.773681 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  28.85 
 
 
224 aa  60.1  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  28.04 
 
 
227 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 
215 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 
215 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 
215 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  28.43 
 
 
203 aa  59.7  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 
215 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 
215 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  31.32 
 
 
213 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.94 
 
 
427 aa  58.9  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  29.67 
 
 
220 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  31.85 
 
 
411 aa  58.9  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03630  6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2, 6-bisphosphatase bifunctional enzyme, putative  29.12 
 
 
658 aa  58.2  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  29.67 
 
 
220 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  30.22 
 
 
220 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1107  fructose-2;6-bisphosphatase  29.68 
 
 
199 aa  58.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  29.48 
 
 
207 aa  58.2  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  28.79 
 
 
196 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  32.88 
 
 
223 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  29.85 
 
 
181 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3230  phosphoglycerate mutase  32.57 
 
 
194 aa  57.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  29.12 
 
 
221 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2679  phosphoglycerate mutase  24.23 
 
 
196 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2747  phosphoglycerate mutase  24.23 
 
 
196 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  29.12 
 
 
221 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  31.85 
 
 
241 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 
194 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45200  predicted protein  25.93 
 
 
547 aa  57  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0267  Phosphoglycerate mutase  27.84 
 
 
232 aa  56.6  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0998048 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  27.37 
 
 
190 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  29.86 
 
 
440 aa  56.6  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  28.37 
 
 
218 aa  56.6  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.33 
 
 
382 aa  56.6  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  29.21 
 
 
215 aa  56.2  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0435  putative phosphoglycerate mutase family protein  25.89 
 
 
193 aa  55.8  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17495  bifunctional 6-phosphofructo-2-kinase  27.2 
 
 
540 aa  55.8  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1203  phosphoglycerate mutase  27.37 
 
 
190 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0965  Phosphoglycerate mutase  26.14 
 
 
231 aa  55.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564706  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  29.61 
 
 
229 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  29.61 
 
 
220 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04983  phosphoglycerate mutase family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G10050)  26.88 
 
 
651 aa  54.7  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  28.33 
 
 
378 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 
201 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  34.45 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2637  phosphoglycerate mutase  28.14 
 
 
190 aa  55.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00707522  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  29.61 
 
 
220 aa  55.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 
240 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0245  phosphoglycerate mutase  30.94 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.044549 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  27.82 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 
378 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1146  phosphoglycerate mutase  27.39 
 
 
233 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017223  normal  0.0174129 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  33.58 
 
 
402 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0769  phosphoglycerate mutase  30.29 
 
 
197 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.578842  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  28.02 
 
 
221 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  29.55 
 
 
215 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  29.55 
 
 
215 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  29.55 
 
 
215 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  34.19 
 
 
226 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  29.21 
 
 
213 aa  53.1  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  32 
 
 
237 aa  53.1  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  34.19 
 
 
226 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  34.19 
 
 
226 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>