More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_68318 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009047  PICST_68318  fructose-2,6-bisphosphatase (FBP26)  100 
 
 
456 aa  947    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.995791  normal  0.428172 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10844  hypothetical protein similar to fructose-2,6-bisphosphatase (Eurofung)  62.91 
 
 
443 aa  550  1e-155  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03630  6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2, 6-bisphosphatase bifunctional enzyme, putative  50.88 
 
 
658 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17495  bifunctional 6-phosphofructo-2-kinase  42.56 
 
 
540 aa  348  1e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40330  predicted protein  36.5 
 
 
506 aa  291  1e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85029  6-phosphofructose-2-kinase  34.92 
 
 
892 aa  286  8e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00430923  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05144  hypothetical protein similar to 6-phosphofructo-2-kinase (Eurofung)  35.82 
 
 
700 aa  247  2e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10824  6-phosphofructo-2-kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G05100)  33.41 
 
 
559 aa  244  3e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05980  cytoplasm protein, putative  34.37 
 
 
605 aa  239  8e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.023684  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8706  predicted protein  32.61 
 
 
398 aa  216  5e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.866499  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57978  6-phosphofructo-2-kinase.  29.78 
 
 
547 aa  208  2e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0511  6-phosphofructo-2-kinase  32.84 
 
 
410 aa  193  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0350  Phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 
405 aa  188  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1696  Phosphoglycerate mutase  31.23 
 
 
402 aa  188  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0204  Phosphoglycerate mutase  31.41 
 
 
408 aa  177  3e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0238  phosphoglycerate mutase  30.38 
 
 
402 aa  169  6e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_3092  predicted protein  36.33 
 
 
240 aa  159  7e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.760801  normal  0.0555608 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 
204 aa  80.9  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  31.02 
 
 
193 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  27.92 
 
 
198 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0052  phosphoglycerate mutase family protein  34.05 
 
 
196 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  26.79 
 
 
591 aa  72  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  30.29 
 
 
233 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 
214 aa  69.3  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66347  6-phosphofructo-2-kinase  27.49 
 
 
374 aa  68.6  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.283395  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  29.07 
 
 
188 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  25.52 
 
 
203 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  28.18 
 
 
203 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  25.52 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  26.29 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  30.67 
 
 
208 aa  67  0.0000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  26.2 
 
 
195 aa  66.6  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  25.54 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  29.55 
 
 
201 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  26.04 
 
 
203 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  26.04 
 
 
203 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  25.77 
 
 
203 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  28.05 
 
 
207 aa  65.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0728  phosphoglycerate mutase  25.67 
 
 
195 aa  65.1  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  28.19 
 
 
208 aa  64.7  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  25.15 
 
 
209 aa  65.1  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 
211 aa  64.7  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  25.52 
 
 
203 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  27.7 
 
 
220 aa  63.9  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  27.84 
 
 
197 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4657  Phosphoglycerate mutase  26.4 
 
 
198 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.2831 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4289  phosphoglycerate mutase  26.4 
 
 
207 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.808672 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 
210 aa  63.2  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5528  phosphoglycerate mutase  27.32 
 
 
195 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00985867 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  26.74 
 
 
223 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  27.49 
 
 
235 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02083  phosphoglycerate mutase family protein, putative  29.67 
 
 
259 aa  62.4  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.956321  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 
197 aa  62  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  24.87 
 
 
196 aa  61.6  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2551  Phosphoglycerate mutase  28.25 
 
 
214 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0267  Phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 
232 aa  61.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0998048 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  29.34 
 
 
195 aa  61.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.96 
 
 
443 aa  60.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  26.44 
 
 
203 aa  61.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  29.38 
 
 
213 aa  60.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  30.95 
 
 
205 aa  60.5  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  27.01 
 
 
197 aa  60.5  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  24.12 
 
 
241 aa  59.7  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0424  phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 
193 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.845746  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0435  phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 
193 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  26.95 
 
 
209 aa  58.5  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2288  phosphoglycerate mutase  31.62 
 
 
155 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  26.74 
 
 
196 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  30.05 
 
 
207 aa  59.3  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  28.31 
 
 
212 aa  58.5  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  28.74 
 
 
201 aa  58.2  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  28.74 
 
 
201 aa  58.2  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  30.05 
 
 
207 aa  58.5  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  25.7 
 
 
217 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  25.3 
 
 
200 aa  57.8  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  28 
 
 
203 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 
224 aa  57.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  30.72 
 
 
226 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  30.72 
 
 
226 aa  57.4  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  27.32 
 
 
208 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  29.48 
 
 
203 aa  57.4  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  27.49 
 
 
203 aa  57  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3691  phosphoglycerate mutase  26.8 
 
 
194 aa  57  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.568516 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1751  phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 
189 aa  57  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0730001  normal  0.102833 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3241  phosphoglycerate mutase family protein  29.07 
 
 
196 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0777453  normal  0.210221 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28 
 
 
203 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  28 
 
 
203 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  28 
 
 
203 aa  56.6  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  28 
 
 
203 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  29.34 
 
 
220 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  28 
 
 
203 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  25.99 
 
 
197 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  26.5 
 
 
237 aa  56.2  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  26.47 
 
 
225 aa  56.6  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  24.86 
 
 
256 aa  56.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2605  phosphoglycerate mutase family protein  27.72 
 
 
180 aa  55.1  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.09 
 
 
442 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 
221 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  29.28 
 
 
198 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.78 
 
 
442 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>