114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0651 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0651  phosphoglycerate mutase family protein  100 
 
 		 276 aa  574  1.0000000000000001e-163  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3036  Phosphoglycerate mutase  31.05 
 
 		 258 aa  87  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.943102 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0120  phosphoglycerate mutase  29.82 
 
 		 262 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3699  Phosphoglycerate mutase  28.89 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155498  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0743  phosphoglycerate mutase  25.55 
 
 		 252 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0181  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.84 
 
 		 266 aa  72  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02083  phosphoglycerate mutase family protein, putative  27.23 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.956321  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1588  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 234 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_6517  predicted protein  30.26 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.454064  normal  0.773681 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1302  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 245 aa  62  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106982  decreased coverage  0.000409559 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1052  phosphoglyceromutase  28.06 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.121789  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1988  Phosphoglycerate mutase  30.17 
 
 		 249 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  29.02 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  27.59 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0115  phosphoglyceromutase  26.7 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.838156  normal  0.839133 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0202  phosphoglyceromutase  26.7 
 
 		 207 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2199  Phosphoglycerate mutase  29.74 
 
 		 249 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0611897 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9413  hypothetical protein  28.12 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0424  phosphoglycerate mutase  27.4 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.845746  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0435  phosphoglycerate mutase  27.4 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0336  phosphoglyceromutase  27.18 
 
 		 207 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.76242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  25.98 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  27.22 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  28.37 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  28.8 
 
 		 196 aa  54.7  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3570  phosphoglyceromutase  27.36 
 
 		 210 aa  53.9  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0729  phosphoglycerate mutase  32.16 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000243184 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2250  phosphoglycerate mutase  24.39 
 
 		 213 aa  52.8  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0293006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  28.35 
 
 		 224 aa  52.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0608  Phosphoglycerate mutase  29.21 
 
 		 217 aa  52.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  27.17 
 
 		 212 aa  52  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  27.47 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0198  phosphoglyceromutase  25.37 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1052  phosphoglyceromutase  24.63 
 
 		 206 aa  51.2  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.555771  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1314  phosphoglycerate mutase  30.27 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  26.32 
 
 		 204 aa  51.2  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45200  predicted protein  27.75 
 
 		 547 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  27.37 
 
 		 223 aa  50.4  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0360  phosphoglyceromutase  25.12 
 
 		 207 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.216981  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  25.73 
 
 		 204 aa  50.8  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  26.78 
 
 		 213 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0052  phosphoglycerate mutase family protein  27.08 
 
 		 196 aa  50.1  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0245  phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 		 220 aa  49.3  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.044549 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  26.67 
 
 		 200 aa  49.3  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  26.6 
 
 		 241 aa  49.3  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0990  phosphoglyceromutase  24.14 
 
 		 206 aa  49.3  0.00007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2551  Phosphoglycerate mutase  25.63 
 
 		 214 aa  49.3  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1329  phosphoglyceromutase  24.14 
 
 		 206 aa  49.3  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  31.43 
 
 		 201 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  23.42 
 
 		 591 aa  48.9  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_3092  predicted protein  26.46 
 
 		 240 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.760801  normal  0.0555608 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1520  phosphoglycerate mutase 1 family  23.64 
 
 		 212 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  27.78 
 
 		 197 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1716  alpha-ribazole-5'-phosphate phosphatase, putative  27.69 
 
 		 190 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.507425  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  25.28 
 
 		 230 aa  48.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1950  putative phosphoglycerate mutase protein  24.72 
 
 		 236 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.101421 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1322  phosphoglycerate mutase 1 family protein  23.64 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.191359  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6372  phosphoglycerate mutase  28.14 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1262  Phosphoglycerate mutase  33.62 
 
 		 204 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00931821 
 
 
-
 
NC_002950  PG1513  phosphoribosyltransferase, putative/phosphoglycerate mutase family protein  27.65 
 
 		 438 aa  47  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000537342 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  27.17 
 
 		 208 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0435  putative phosphoglycerate mutase family protein  26.29 
 
 		 193 aa  47  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68318  fructose-2,6-bisphosphatase (FBP26)  24.19 
 
 		 456 aa  47  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.995791  normal  0.428172 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  27.21 
 
 		 253 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1369  Phosphoglycerate mutase  28.18 
 
 		 238 aa  46.6  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.252939  hitchhiker  0.00300055 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  28.74 
 
 		 200 aa  46.6  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0578  phosphoglycerate mutase 1 family  25.39 
 
 		 204 aa  46.6  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  32.37 
 
 		 229 aa  46.2  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  27.51 
 
 		 243 aa  46.2  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5270  phosphoglycerate mutase  26.15 
 
 		 225 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.851193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0587  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 183 aa  46.2  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3186  putative phosphoglycerate mutase  27.68 
 
 		 238 aa  45.8  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3591  phosphoglyceromutase  23.9 
 
 		 206 aa  46.2  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863261  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0965  Phosphoglycerate mutase  27.53 
 
 		 231 aa  45.8  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564706  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  26.92 
 
 		 197 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  27.32 
 
 		 205 aa  45.8  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0290  phosphoglycerate mutase  25.23 
 
 		 220 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.438239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  26.88 
 
 		 188 aa  45.8  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10844  hypothetical protein similar to fructose-2,6-bisphosphatase (Eurofung)  24.86 
 
 		 443 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04983  phosphoglycerate mutase family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G10050)  28.87 
 
 		 651 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2670  phosphohistidine phosphatase, SixA  30.77 
 
 		 157 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1844  phosphoglycerate mutase  27.93 
 
 		 226 aa  45.4  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000187954  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4110  hypothetical protein  26.56 
 
 		 194 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  25.73 
 
 		 209 aa  45.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2170  Phosphoglycerate mutase  27.86 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00522572  normal  0.0339926 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  29.46 
 
 		 363 aa  45.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  23.96 
 
 		 201 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  25.75 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  27.43 
 
 		 223 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3680  phosphoglycerate mutase  24.34 
 
 		 186 aa  44.3  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  25.23 
 
 		 206 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0267  Phosphoglycerate mutase  27.43 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0998048 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  27.33 
 
 		 215 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47660  hypothetical protein  26.56 
 
 		 194 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0822377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 		 199 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0242  phosphoglycerate mutase  29.75 
 
 		 261 aa  43.5  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  26.19 
 
 		 213 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1846  Phosphoglycerate mutase  27.86 
 
 		 244 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  decreased coverage  0.00463993 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1596  phosphoglycerate mutase  27.47 
 
 		 220 aa  43.5  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0120302  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5140  Phosphoglycerate mutase  27.57 
 
 		 214 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>