198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1369 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1369  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 238 aa  487  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.252939  hitchhiker  0.00300055 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3186  putative phosphoglycerate mutase  93.7 
 
 		 238 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1985  phosphoglycerate mutase  73.84 
 
 		 240 aa  368  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1315  phosphoglycerate mutase family protein  72.22 
 
 		 237 aa  340  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1324  phosphoglycerate mutase family protein  72.22 
 
 		 237 aa  340  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1155  putative phosphoglycerate mutase  72.22 
 
 		 237 aa  339  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0632256  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0713  putative phosphoglycerate mutase  72.22 
 
 		 237 aa  339  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.107866  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0438  putative phosphoglycerate mutase  72.22 
 
 		 237 aa  339  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1804  phosphoglycerate mutase, putative  71.79 
 
 		 237 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.991276  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1461  phosphoglycerate mutase family protein  71.79 
 
 		 237 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.861833  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1085  phosphoglycerate mutase, putative  70.94 
 
 		 237 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1846  Phosphoglycerate mutase  59.09 
 
 		 244 aa  290  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  decreased coverage  0.00463993 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2170  Phosphoglycerate mutase  59.09 
 
 		 244 aa  289  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00522572  normal  0.0339926 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2015  putative phosphoglycerate mutase protein  61.83 
 
 		 244 aa  285  2.9999999999999996e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.458682  normal  0.0388095 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1008  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  59.91 
 
 		 241 aa  259  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1950  putative phosphoglycerate mutase protein  53.45 
 
 		 236 aa  229  3e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.101421 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2594  phosphoglycerate mutase  36.22 
 
 		 240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.440152  normal  0.139098 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3089  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351305 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  29.84 
 
 		 448 aa  75.1  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  29.15 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.1 
 
 		 443 aa  72.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  29.32 
 
 		 448 aa  71.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 		 447 aa  69.3  0.00000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  30.96 
 
 		 198 aa  68.2  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  26.6 
 
 		 447 aa  65.5  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.44 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30 
 
 		 449 aa  64.3  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  33.68 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  30.35 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.23 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.27 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  29.76 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  30.32 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  28.79 
 
 		 445 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  29.79 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  34.57 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  30.89 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  32.18 
 
 		 207 aa  62  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.61 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  29.5 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  31.09 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  32.95 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  27.67 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  27.5 
 
 		 452 aa  58.5  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  30.77 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  30.3 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  27.83 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  34.15 
 
 		 181 aa  57.4  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  33.9 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  27.84 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.13 
 
 		 442 aa  55.5  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  29.8 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  24.88 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  30.46 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13240  acid phosphatase  30.06 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.550625 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.32 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  27.32 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.09 
 
 		 442 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  27.32 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  27.32 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  28.8 
 
 		 205 aa  53.5  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  27.32 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  27.32 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  29.7 
 
 		 214 aa  52.8  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07531  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.71 
 
 		 547 aa  52.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3737  phosphoglycerate mutase  26.98 
 
 		 228 aa  52.4  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.791963 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.9 
 
 		 444 aa  52  0.000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 		 205 aa  52  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2776  Phosphoglycerate mutase  31.18 
 
 		 242 aa  52  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787137  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  27.32 
 
 		 203 aa  52  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  28.83 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  25.75 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  29.7 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  26.04 
 
 		 459 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.37 
 
 		 442 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  22.38 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  28.83 
 
 		 226 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  25.52 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  24.88 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  24.88 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.04 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1113  Phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.28293  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1760  phosphoglycerate mutase family protein  26.6 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000115709  normal  0.449804 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0238  phosphoglycerate mutase  29.34 
 
 		 402 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  31.36 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  31.33 
 
 		 208 aa  49.3  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  32.08 
 
 		 241 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5107  phosphoglycerate mutase family protein, putative  27.54 
 
 		 184 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  31.84 
 
 		 196 aa  48.9  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 214 aa  48.5  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  24.37 
 
 		 204 aa  48.5  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  28.4 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  23.64 
 
 		 207 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  29.52 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  27.6 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>