158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2015 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2015  putative phosphoglycerate mutase protein  100 
 
 		 244 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.458682  normal  0.0388095 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1846  Phosphoglycerate mutase  85.25 
 
 		 244 aa  424  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  decreased coverage  0.00463993 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2170  Phosphoglycerate mutase  85.25 
 
 		 244 aa  424  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00522572  normal  0.0339926 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1008  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  68.46 
 
 		 241 aa  317  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3186  putative phosphoglycerate mutase  63.49 
 
 		 238 aa  305  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1369  Phosphoglycerate mutase  61.83 
 
 		 238 aa  300  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.252939  hitchhiker  0.00300055 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1324  phosphoglycerate mutase family protein  58.23 
 
 		 237 aa  270  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1155  putative phosphoglycerate mutase  58.23 
 
 		 237 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0632256  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0713  putative phosphoglycerate mutase  58.23 
 
 		 237 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.107866  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1315  phosphoglycerate mutase family protein  58.23 
 
 		 237 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0438  putative phosphoglycerate mutase  58.23 
 
 		 237 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1804  phosphoglycerate mutase, putative  57.81 
 
 		 237 aa  268  4e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.991276  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1461  phosphoglycerate mutase family protein  57.81 
 
 		 237 aa  268  7e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.861833  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1985  phosphoglycerate mutase  57.81 
 
 		 240 aa  265  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1085  phosphoglycerate mutase, putative  58.23 
 
 		 237 aa  254  7e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1950  putative phosphoglycerate mutase protein  54.51 
 
 		 236 aa  230  1e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.101421 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3089  phosphoglycerate mutase  36.69 
 
 		 252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351305 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2594  phosphoglycerate mutase  33.47 
 
 		 240 aa  112  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.440152  normal  0.139098 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  31.79 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  30.21 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  32.29 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.88 
 
 		 443 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  30.48 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.06 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  29 
 
 		 447 aa  64.3  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  29.19 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  28.21 
 
 		 448 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  32.57 
 
 		 223 aa  62  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  29.13 
 
 		 225 aa  62  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  28.51 
 
 		 448 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.67 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  29.25 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  35.09 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.36 
 
 		 442 aa  59.7  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  30.06 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 		 447 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30 
 
 		 449 aa  58.9  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.19 
 
 		 442 aa  58.9  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  28.1 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.5 
 
 		 442 aa  58.5  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  31.07 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.81 
 
 		 442 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  26.56 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  34.68 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  30.21 
 
 		 445 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1756  phosphoglycerate mutase-like protein  28.21 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.14183 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  32.95 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  27.62 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  32.4 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  27.08 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  28.84 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  28.57 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1627  phosphoglycerate mutase  31.67 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  27.32 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  28.23 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  26.51 
 
 		 200 aa  53.1  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  26.51 
 
 		 200 aa  53.1  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1198  phosphoglyceromutase  28.12 
 
 		 249 aa  52.4  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  26.87 
 
 		 452 aa  52.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  29.8 
 
 		 221 aa  52.4  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0239  phosphoglycerate mutase  28.06 
 
 		 218 aa  52.4  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 245 aa  52  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  31.16 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02129  hypothetical protein  31.03 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  28.4 
 
 		 213 aa  51.6  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28 
 
 		 444 aa  50.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  27.98 
 
 		 202 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 181 aa  51.2  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3403  aminotransferase class I and II  41.05 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0624643  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  32.22 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  32.22 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0251  phosphoglycerate mutase family protein  27.96 
 
 		 223 aa  50.1  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  30.49 
 
 		 215 aa  50.4  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  30.23 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0287  phosphoglyceromutase  26.56 
 
 		 248 aa  50.1  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  27.86 
 
 		 198 aa  49.7  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  27 
 
 		 203 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  28.12 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  28.4 
 
 		 207 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  26.63 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07531  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.29 
 
 		 547 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  27.98 
 
 		 198 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  29.82 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  27.14 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  27.14 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  20.75 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  29.11 
 
 		 214 aa  47.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  28.64 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  29.77 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0501  phosphoglycerate mutase 1  37.84 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0841539  normal  0.749431 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  35.4 
 
 		 218 aa  47  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  28.72 
 
 		 591 aa  46.6  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  26.5 
 
 		 203 aa  47  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  25.91 
 
 		 200 aa  47  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  25.38 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>