141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_1846 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1846  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
244 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  decreased coverage  0.00463993 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2170  Phosphoglycerate mutase  97.54 
 
 
244 aa  488  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00522572  normal  0.0339926 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2015  putative phosphoglycerate mutase protein  85.25 
 
 
244 aa  407  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.458682  normal  0.0388095 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1008  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  69.17 
 
 
241 aa  315  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3186  putative phosphoglycerate mutase  61.57 
 
 
238 aa  298  7e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1369  Phosphoglycerate mutase  59.09 
 
 
238 aa  290  1e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.252939  hitchhiker  0.00300055 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1324  phosphoglycerate mutase family protein  58.47 
 
 
237 aa  268  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1155  putative phosphoglycerate mutase  58.47 
 
 
237 aa  268  7e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0632256  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0713  putative phosphoglycerate mutase  58.47 
 
 
237 aa  268  7e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.107866  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0438  putative phosphoglycerate mutase  58.47 
 
 
237 aa  268  7e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1461  phosphoglycerate mutase family protein  58.05 
 
 
237 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.861833  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1315  phosphoglycerate mutase family protein  58.05 
 
 
237 aa  267  1e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1804  phosphoglycerate mutase, putative  58.05 
 
 
237 aa  266  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.991276  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1985  phosphoglycerate mutase  56.72 
 
 
240 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1085  phosphoglycerate mutase, putative  58.47 
 
 
237 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1950  putative phosphoglycerate mutase protein  53.42 
 
 
236 aa  228  6e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.101421 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2594  phosphoglycerate mutase  34.6 
 
 
240 aa  121  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.440152  normal  0.139098 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3089  phosphoglycerate mutase  36.69 
 
 
252 aa  117  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0351305 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  34.13 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  30.48 
 
 
217 aa  64.3  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 
223 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 
225 aa  63.2  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  27.98 
 
 
201 aa  63.2  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  31.12 
 
 
235 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 
447 aa  61.2  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.12 
 
 
449 aa  61.2  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  32.16 
 
 
218 aa  59.7  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  29.56 
 
 
213 aa  59.7  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  30.05 
 
 
197 aa  58.9  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  30.73 
 
 
227 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1756  phosphoglycerate mutase-like protein  27.98 
 
 
219 aa  58.2  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.14183 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  25.39 
 
 
200 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  33.53 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  30.35 
 
 
256 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  28.37 
 
 
207 aa  57.4  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  29.02 
 
 
241 aa  56.6  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4087  phosphoglycerate mutase  30.32 
 
 
215 aa  56.6  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  29.44 
 
 
201 aa  56.2  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  32.18 
 
 
241 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.28 
 
 
442 aa  55.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  27.96 
 
 
200 aa  55.5  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2908  Phosphoglycerate mutase  30.06 
 
 
219 aa  55.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.29 
 
 
442 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.96 
 
 
443 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  34.36 
 
 
181 aa  54.7  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  30.35 
 
 
198 aa  53.9  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  29.61 
 
 
208 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  29.05 
 
 
209 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  31.4 
 
 
245 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  27.84 
 
 
198 aa  53.1  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  26.56 
 
 
200 aa  53.1  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36168  predicted protein  29.44 
 
 
340 aa  52.4  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0251  phosphoglycerate mutase family protein  29.26 
 
 
223 aa  52.4  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  24.35 
 
 
200 aa  52  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  24.35 
 
 
200 aa  52  0.000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 
202 aa  52  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  24.35 
 
 
200 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  29.09 
 
 
214 aa  51.2  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  28.17 
 
 
214 aa  51.2  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  42.42 
 
 
198 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0476  phosphoglycerate mutase family protein  27.88 
 
 
195 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00558818  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  29.9 
 
 
221 aa  50.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  27.98 
 
 
445 aa  50.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.75 
 
 
442 aa  50.1  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1627  phosphoglycerate mutase  29.29 
 
 
217 aa  50.1  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1881  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
203 aa  50.1  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  29.21 
 
 
226 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5140  Phosphoglycerate mutase  29.24 
 
 
214 aa  49.7  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  29.21 
 
 
226 aa  49.7  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  28.04 
 
 
214 aa  49.3  0.00006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  28.04 
 
 
214 aa  48.9  0.00007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  30.23 
 
 
230 aa  48.9  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  21.13 
 
 
228 aa  48.5  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  27.61 
 
 
198 aa  48.5  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  26.8 
 
 
591 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  26.4 
 
 
200 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  28.25 
 
 
193 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3224  Phosphoglycerate mutase  27.78 
 
 
191 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.12947  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1198  phosphoglyceromutase  28.06 
 
 
249 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2156  Phosphoglycerate mutase  27.07 
 
 
202 aa  47.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0965  Phosphoglycerate mutase  26.01 
 
 
231 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564706  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3403  aminotransferase class I and II  31.93 
 
 
188 aa  47  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0624643  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  27.65 
 
 
213 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  29.17 
 
 
214 aa  47  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1760  phosphoglycerate mutase family protein  25.89 
 
 
199 aa  46.2  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000115709  normal  0.449804 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3076  phosphoglyceromutase  24.38 
 
 
250 aa  46.2  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  24.38 
 
 
250 aa  46.6  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  26.91 
 
 
213 aa  46.6  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1052  phosphoglyceromutase  29.1 
 
 
206 aa  46.2  0.0005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.121789  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 
230 aa  46.2  0.0005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  30.1 
 
 
203 aa  46.2  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2861  phosphoglyceromutase  25.63 
 
 
250 aa  46.2  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  24.1 
 
 
250 aa  46.2  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1407  phosphoglyceromutase  25.63 
 
 
250 aa  46.2  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2948  phosphoglyceromutase  25.63 
 
 
250 aa  46.2  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  25.51 
 
 
203 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  27.59 
 
 
447 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0304  phosphoglycerate mutase  27.88 
 
 
222 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.484417  normal  0.3074 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0287  phosphoglyceromutase  30.28 
 
 
248 aa  45.8  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  22.61 
 
 
204 aa  45.4  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.628079 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>