96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1314 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1314  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
226 aa  473  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0608  Phosphoglycerate mutase  47.91 
 
 
217 aa  192  5e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_6517  predicted protein  41.24 
 
 
202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.454064  normal  0.773681 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04983  phosphoglycerate mutase family domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G10050)  39.56 
 
 
651 aa  150  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45200  predicted protein  36.73 
 
 
547 aa  145  7.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85057  predicted protein  44.52 
 
 
276 aa  118  6e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1988  Phosphoglycerate mutase  34.45 
 
 
249 aa  101  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2199  Phosphoglycerate mutase  31.8 
 
 
249 aa  95.1  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0611897 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6372  phosphoglycerate mutase  28.16 
 
 
268 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0181  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.91 
 
 
266 aa  68.6  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0055  Phosphoglycerate mutase  33.81 
 
 
216 aa  59.7  0.00000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0249484  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2747  phosphoglycerate mutase  27.93 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2679  phosphoglycerate mutase  28.31 
 
 
196 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  24.23 
 
 
208 aa  56.2  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3699  Phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 
253 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155498  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  27.95 
 
 
207 aa  54.7  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1844  phosphoglycerate mutase  36.78 
 
 
226 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000187954  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  26.42 
 
 
217 aa  54.3  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2605  phosphoglycerate mutase family protein  26.97 
 
 
180 aa  53.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9413  hypothetical protein  32.93 
 
 
242 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0120  phosphoglycerate mutase  27.4 
 
 
262 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0743  phosphoglycerate mutase  28.71 
 
 
252 aa  52  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702644  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08720  phosphoglycerate mutase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G02600)  26.4 
 
 
239 aa  51.2  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0651  phosphoglycerate mutase family protein  30.27 
 
 
276 aa  50.8  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02083  phosphoglycerate mutase family protein, putative  29.28 
 
 
259 aa  50.8  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.956321  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0773  phosphoglycerate mutase  37.93 
 
 
205 aa  50.1  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.880145  normal  0.0308619 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0435  putative phosphoglycerate mutase family protein  28.05 
 
 
193 aa  49.3  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  30.25 
 
 
212 aa  49.3  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0736  phosphoglycerate mutase (GpmB protein)-like  31.48 
 
 
208 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  28.24 
 
 
196 aa  49.3  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  37.11 
 
 
214 aa  48.5  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  30.46 
 
 
213 aa  48.5  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  28.02 
 
 
212 aa  48.5  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  37.11 
 
 
214 aa  48.5  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  31.78 
 
 
201 aa  48.5  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0424  phosphoglycerate mutase  27.47 
 
 
193 aa  48.5  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.845746  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0435  phosphoglycerate mutase  27.47 
 
 
193 aa  48.5  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0587  Phosphoglycerate mutase  29.59 
 
 
183 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  29.48 
 
 
212 aa  48.1  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
227 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  26.7 
 
 
203 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0115  phosphoglyceromutase  28.9 
 
 
212 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.838156  normal  0.839133 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  31.21 
 
 
223 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0052  phosphoglycerate mutase family protein  28.57 
 
 
196 aa  47  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  30 
 
 
213 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3036  Phosphoglycerate mutase  27.53 
 
 
258 aa  47  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.943102 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  33.33 
 
 
220 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  35.54 
 
 
229 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  33.33 
 
 
229 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
240 aa  46.6  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  33.33 
 
 
220 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  35.54 
 
 
220 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  25.67 
 
 
195 aa  46.2  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  35.54 
 
 
220 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  35.54 
 
 
220 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0344  Phosphoglycerate mutase  41.43 
 
 
219 aa  45.8  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1307  phosphoglycerate mutase family protein  25 
 
 
236 aa  46.2  0.0005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5585  Phosphoglycerate mutase  43.48 
 
 
209 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393552  normal  0.0995735 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  28.4 
 
 
213 aa  45.4  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  36.08 
 
 
214 aa  45.4  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  36.08 
 
 
214 aa  45.4  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1751  phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 
189 aa  45.1  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0730001  normal  0.102833 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0775  Phosphoglycerate mutase  27.71 
 
 
190 aa  45.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1313  phosphoglycerate mutase  37.61 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1837  phosphoglycerate mutase  25.46 
 
 
217 aa  44.3  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  32 
 
 
221 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  42.25 
 
 
220 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  32 
 
 
221 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  32 
 
 
221 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2672  phosphoglycerate mutase  45.59 
 
 
176 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89865  phosphoglycerate mutase  24.48 
 
 
244 aa  44.3  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.889408  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1372  Phosphoglycerate mutase  26.7 
 
 
193 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1146  phosphoglycerate mutase  25.75 
 
 
233 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017223  normal  0.0174129 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4997  Phosphoglycerate mutase  29.01 
 
 
238 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118057  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1107  fructose-2;6-bisphosphatase  27.95 
 
 
199 aa  43.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0856  phosphoglycerate mutase  28.4 
 
 
191 aa  43.5  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01160  fructose-2,6-bisphosphatase  27.17 
 
 
224 aa  43.1  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  35.48 
 
 
234 aa  43.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  32.67 
 
 
220 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3570  phosphoglyceromutase  26.98 
 
 
210 aa  43.1  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  29.26 
 
 
198 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0444  phosphoglyceromutase  26.47 
 
 
208 aa  42.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.114535  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2898  Phosphoglycerate mutase  23.94 
 
 
208 aa  42.4  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2319  phosphoglycerate mutase  36.78 
 
 
238 aa  42.4  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0965  Phosphoglycerate mutase  27.64 
 
 
231 aa  42.4  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564706  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0310  phosphoglycerate mutase  28.35 
 
 
222 aa  42.4  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0260  Phosphoglycerate mutase  29.71 
 
 
207 aa  42.4  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.13197  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  25.47 
 
 
224 aa  42  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  30.14 
 
 
220 aa  42  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3809  phosphoglyceromutase  24.12 
 
 
206 aa  42  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0780589 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3846  phosphoglycerate mutase  45.59 
 
 
194 aa  41.6  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1516  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 
215 aa  41.6  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.481804 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  29.45 
 
 
220 aa  41.6  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 
211 aa  41.6  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  36 
 
 
213 aa  41.6  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>