49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3846 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3846  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
194 aa  403  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4450  phosphoglycerate mutase family protein  40.59 
 
 
208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000191223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0965  Phosphoglycerate mutase  37.37 
 
 
231 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564706  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5116  phosphoglycerate mutase  40.1 
 
 
209 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.156451  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5383  phosphoglycerate mutase family protein  40.59 
 
 
204 aa  124  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5585  Phosphoglycerate mutase  40 
 
 
209 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393552  normal  0.0995735 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0304  phosphoglycerate mutase  35.38 
 
 
222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.484417  normal  0.3074 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1844  phosphoglycerate mutase  36.25 
 
 
226 aa  101  5e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000187954  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
237 aa  57  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  30.18 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0350  Phosphoglycerate mutase  31.93 
 
 
405 aa  52  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  31.21 
 
 
214 aa  50.4  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  30.97 
 
 
181 aa  50.1  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  30.13 
 
 
214 aa  49.7  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  26.9 
 
 
207 aa  48.5  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  28.38 
 
 
195 aa  47.4  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  30.6 
 
 
213 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0540  phosphoglycerate mutase  29.88 
 
 
193 aa  47  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.803779  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  30.82 
 
 
214 aa  47  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  27.56 
 
 
198 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 
197 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  44.78 
 
 
213 aa  46.2  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  42.65 
 
 
253 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 
223 aa  45.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  28.34 
 
 
213 aa  45.1  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0435  phosphoglycerate mutase  25.44 
 
 
193 aa  45.1  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0424  phosphoglycerate mutase  25.44 
 
 
193 aa  45.1  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.845746  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0349  Phosphoglycerate mutase  30.72 
 
 
227 aa  45.1  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 
214 aa  44.7  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  26.95 
 
 
205 aa  44.3  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45200  predicted protein  38.89 
 
 
547 aa  43.9  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  25.62 
 
 
210 aa  43.9  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  30.6 
 
 
213 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  36 
 
 
203 aa  43.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  28.16 
 
 
225 aa  43.9  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3403  aminotransferase class I and II  29.75 
 
 
188 aa  42.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0624643  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  30.49 
 
 
223 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0511  6-phosphofructo-2-kinase  27.27 
 
 
410 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  32.86 
 
 
215 aa  42.4  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  25.44 
 
 
198 aa  42.4  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3506  Phosphoglycerate mutase  41.27 
 
 
227 aa  42.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  28.31 
 
 
230 aa  42  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1972  phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 
238 aa  42.4  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  26.09 
 
 
370 aa  42  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0084  Phosphoglycerate mutase  37.14 
 
 
207 aa  42.4  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1185  Phosphoglycerate mutase  30.72 
 
 
191 aa  42  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  29.75 
 
 
224 aa  42  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1314  phosphoglycerate mutase  45.59 
 
 
226 aa  41.6  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3241  phosphoglycerate mutase family protein  28.22 
 
 
196 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0777453  normal  0.210221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>