151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0349 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0349  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.805454  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  32 
 
 
211 aa  62.8  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01160  fructose-2,6-bisphosphatase  37.04 
 
 
224 aa  59.7  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 
214 aa  58.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  39.02 
 
 
208 aa  57.4  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  36.5 
 
 
213 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  33.97 
 
 
213 aa  55.8  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1696  Phosphoglycerate mutase  35 
 
 
402 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  27.17 
 
 
213 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  30.14 
 
 
200 aa  55.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 
220 aa  54.7  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5604  phosphoglycerate mutase  31.88 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.335394  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 
230 aa  53.9  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  28.66 
 
 
212 aa  54.3  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 
210 aa  53.1  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0204  Phosphoglycerate mutase  29.47 
 
 
408 aa  52.8  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  25.17 
 
 
208 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
195 aa  52.4  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  31.91 
 
 
223 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  24.15 
 
 
188 aa  52.4  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  30.22 
 
 
215 aa  52  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0350  Phosphoglycerate mutase  27.08 
 
 
405 aa  52  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 
234 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5917  phosphoglycerate mutase  32.87 
 
 
238 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  35.62 
 
 
213 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  31.14 
 
 
203 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
391 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89865  phosphoglycerate mutase  29.86 
 
 
244 aa  49.7  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.889408  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  32.39 
 
 
222 aa  49.7  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  32.39 
 
 
222 aa  49.7  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  26.23 
 
 
206 aa  49.3  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0238  phosphoglycerate mutase  31.62 
 
 
402 aa  49.3  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0502  phosphoglycerate mutase  34.68 
 
 
201 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1788  acid phosphatase  29 
 
 
203 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3452  phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 
200 aa  48.9  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12100  fructose-2,6-bisphosphatase  29.45 
 
 
279 aa  48.9  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0451501  normal  0.0684118 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  29.5 
 
 
215 aa  48.5  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  29.5 
 
 
215 aa  48.5  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  29.5 
 
 
215 aa  48.5  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  25 
 
 
205 aa  48.9  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  27.85 
 
 
220 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  32.84 
 
 
196 aa  48.5  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  28.16 
 
 
223 aa  48.5  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  26.34 
 
 
201 aa  48.5  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  38.75 
 
 
205 aa  47.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  32.08 
 
 
412 aa  47.8  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  31.52 
 
 
243 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  28.24 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1203  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 
203 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  27.42 
 
 
234 aa  48.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  27.23 
 
 
198 aa  47.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  28.02 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  33.1 
 
 
213 aa  47.8  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  32.33 
 
 
194 aa  47  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  25.99 
 
 
214 aa  47  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  27.85 
 
 
220 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  26.77 
 
 
198 aa  47  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0511  6-phosphofructo-2-kinase  29.5 
 
 
410 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 
224 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  28.14 
 
 
209 aa  46.6  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  25.49 
 
 
233 aa  47  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3383  phosphoglycerate mutase  27.01 
 
 
204 aa  46.6  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  28.8 
 
 
209 aa  46.6  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  28.48 
 
 
221 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  28.48 
 
 
221 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  28.48 
 
 
221 aa  46.2  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  27.23 
 
 
198 aa  45.8  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  30.46 
 
 
213 aa  45.8  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  34.44 
 
 
203 aa  46.2  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3007  phosphohistidine phosphatase, SixA  39.18 
 
 
153 aa  46.2  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  25.99 
 
 
214 aa  45.8  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3949  Phosphoglycerate mutase  30.17 
 
 
232 aa  46.2  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00773926  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  28.87 
 
 
215 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  28.87 
 
 
215 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  28.87 
 
 
215 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  28.87 
 
 
215 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  28.87 
 
 
215 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  26.48 
 
 
223 aa  45.8  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  30.61 
 
 
232 aa  45.8  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  28.14 
 
 
189 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  26.48 
 
 
215 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1141  phosphoglycerate mutase  30 
 
 
197 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  32.86 
 
 
197 aa  45.4  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1422  acid phosphatase  30.36 
 
 
203 aa  45.4  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592625  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  26.48 
 
 
215 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3506  Phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 
227 aa  45.4  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  34.74 
 
 
212 aa  45.1  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0290  phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 
220 aa  45.1  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.438239  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  27.22 
 
 
220 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1388  acid phosphatase  30.36 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2817  phosphoglycerate mutase  27.42 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00859935  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1406  acid phosphatase  30.36 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.537444  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1028  Phosphoglycerate mutase  46.03 
 
 
200 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3846  phosphoglycerate mutase  30.72 
 
 
194 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2851  phosphoglycerate mutase  38 
 
 
189 aa  44.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.796237  normal  0.0465369 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  25.85 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  29.03 
 
 
223 aa  45.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0942  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  39.08 
 
 
170 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.574003  normal  0.218126 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  31.34 
 
 
216 aa  44.3  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  29.08 
 
 
215 aa  43.5  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>