More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0511 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0511  6-phosphofructo-2-kinase  100 
 
 
410 aa  837    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0238  phosphoglycerate mutase  67.16 
 
 
402 aa  560  1e-158  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1696  Phosphoglycerate mutase  65.68 
 
 
402 aa  537  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0350  Phosphoglycerate mutase  52.84 
 
 
405 aa  432  1e-120  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0204  Phosphoglycerate mutase  49.88 
 
 
408 aa  403  1e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10844  hypothetical protein similar to fructose-2,6-bisphosphatase (Eurofung)  36.57 
 
 
443 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03630  6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2, 6-bisphosphatase bifunctional enzyme, putative  33.33 
 
 
658 aa  196  8.000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68318  fructose-2,6-bisphosphatase (FBP26)  32.84 
 
 
456 aa  193  6e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.995791  normal  0.428172 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17495  bifunctional 6-phosphofructo-2-kinase  31.98 
 
 
540 aa  183  6e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40330  predicted protein  32.15 
 
 
506 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85029  6-phosphofructose-2-kinase  28.82 
 
 
892 aa  144  3e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00430923  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05144  hypothetical protein similar to 6-phosphofructo-2-kinase (Eurofung)  28.28 
 
 
700 aa  126  6e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8706  predicted protein  27.59 
 
 
398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.866499  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05980  cytoplasm protein, putative  25.48 
 
 
605 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.023684  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_3092  predicted protein  32.77 
 
 
240 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.760801  normal  0.0555608 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10824  6-phosphofructo-2-kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G05100)  23.48 
 
 
559 aa  97.8  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 
204 aa  80.5  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  30 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  30 
 
 
203 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  34.73 
 
 
214 aa  79.7  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 
214 aa  79  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  30 
 
 
205 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 
198 aa  78.6  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  32.94 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 
208 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  30 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  29.44 
 
 
203 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  29.44 
 
 
203 aa  77  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  31.52 
 
 
200 aa  77  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 
195 aa  76.6  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  30.17 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  29.44 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.09 
 
 
442 aa  76.3  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
214 aa  75.9  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1751  phosphoglycerate mutase  32.2 
 
 
189 aa  76.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0730001  normal  0.102833 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.52 
 
 
200 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  31.52 
 
 
200 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  29.7 
 
 
200 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.94 
 
 
442 aa  74.7  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32 
 
 
442 aa  74.3  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  29.59 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.17 
 
 
442 aa  73.6  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.23 
 
 
444 aa  73.6  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  31.67 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  27.87 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  33.13 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  28.96 
 
 
203 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.48 
 
 
442 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  33.15 
 
 
207 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  30.91 
 
 
202 aa  72  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 
213 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  30.91 
 
 
202 aa  71.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  30.91 
 
 
202 aa  71.2  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  32.72 
 
 
205 aa  70.9  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  30.91 
 
 
213 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  32.53 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  30.12 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 
213 aa  70.5  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.67 
 
 
442 aa  70.9  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  30.64 
 
 
241 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66347  6-phosphofructo-2-kinase  26.74 
 
 
374 aa  70.5  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.283395  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1516  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
215 aa  70.1  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.481804 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  30.36 
 
 
197 aa  70.1  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.45 
 
 
442 aa  70.1  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07531  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.28 
 
 
547 aa  70.1  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.93 
 
 
443 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  33.96 
 
 
224 aa  69.3  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 
208 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 
221 aa  68.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  30.3 
 
 
202 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 
215 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 
215 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  30.05 
 
 
205 aa  68.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  29.19 
 
 
200 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0290  phosphoglycerate mutase  30.63 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.438239  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 
210 aa  67.4  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  28.31 
 
 
207 aa  67  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0245  phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.044549 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  27.42 
 
 
207 aa  67  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3224  Phosphoglycerate mutase  30.49 
 
 
191 aa  66.6  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.12947  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 
214 aa  65.9  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  33.79 
 
 
440 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 
200 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  29.7 
 
 
209 aa  65.1  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  29.78 
 
 
445 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  28.22 
 
 
591 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.84 
 
 
203 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  26.84 
 
 
203 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  27.49 
 
 
209 aa  64.7  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  31.48 
 
 
213 aa  64.3  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  26.84 
 
 
203 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  26.84 
 
 
203 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  30.93 
 
 
197 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  26.84 
 
 
203 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  30.36 
 
 
447 aa  64.7  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  26.84 
 
 
203 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  26.82 
 
 
217 aa  64.7  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>