99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_85029 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009047  PICST_85029  6-phosphofructose-2-kinase  100 
 
 
892 aa  1842    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00430923  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05144  hypothetical protein similar to 6-phosphofructo-2-kinase (Eurofung)  45.75 
 
 
700 aa  512  1e-143  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10844  hypothetical protein similar to fructose-2,6-bisphosphatase (Eurofung)  36.73 
 
 
443 aa  306  8.000000000000001e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03630  6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2, 6-bisphosphatase bifunctional enzyme, putative  38.46 
 
 
658 aa  301  2e-80  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17495  bifunctional 6-phosphofructo-2-kinase  35.8 
 
 
540 aa  291  3e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68318  fructose-2,6-bisphosphatase (FBP26)  34.92 
 
 
456 aa  285  3.0000000000000004e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.995791  normal  0.428172 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40330  predicted protein  35.21 
 
 
506 aa  262  2e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05980  cytoplasm protein, putative  30.3 
 
 
605 aa  209  1e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.023684  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10824  6-phosphofructo-2-kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G05100)  28.39 
 
 
559 aa  191  4e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57978  6-phosphofructo-2-kinase.  28.16 
 
 
547 aa  190  1e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8706  predicted protein  29.42 
 
 
398 aa  186  1.0000000000000001e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.866499  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1696  Phosphoglycerate mutase  27.66 
 
 
402 aa  147  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0511  6-phosphofructo-2-kinase  28.82 
 
 
410 aa  144  8e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0204  Phosphoglycerate mutase  27.63 
 
 
408 aa  135  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0238  phosphoglycerate mutase  25.11 
 
 
402 aa  135  5e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0350  Phosphoglycerate mutase  27.41 
 
 
405 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_3092  predicted protein  29.63 
 
 
240 aa  120  9e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.760801  normal  0.0555608 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66347  6-phosphofructo-2-kinase  32.39 
 
 
374 aa  100  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.283395  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  41.32 
 
 
202 aa  68.2  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  35.71 
 
 
197 aa  67.4  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  28.37 
 
 
223 aa  67  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5528  phosphoglycerate mutase  40 
 
 
195 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00985867 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  35.76 
 
 
200 aa  65.9  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  34.13 
 
 
241 aa  65.5  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  35.71 
 
 
256 aa  65.5  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  41.51 
 
 
201 aa  64.7  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  30.83 
 
 
217 aa  64.3  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  28.44 
 
 
207 aa  62.4  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  27.59 
 
 
207 aa  62.8  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 
215 aa  62  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  28.44 
 
 
207 aa  61.2  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 
198 aa  61.2  0.00000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 
215 aa  60.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  39.64 
 
 
200 aa  59.3  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  30.63 
 
 
213 aa  58.9  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  40.51 
 
 
197 aa  58.2  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  31.76 
 
 
198 aa  58.2  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  28.78 
 
 
201 aa  58.2  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2551  Phosphoglycerate mutase  25.35 
 
 
214 aa  57.4  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0728  phosphoglycerate mutase  26.29 
 
 
195 aa  57.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1026  Phosphoglycerate mutase  24.78 
 
 
212 aa  57.4  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411321  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  32.14 
 
 
591 aa  57.4  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  29.53 
 
 
201 aa  57  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  34.51 
 
 
198 aa  56.6  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  30.97 
 
 
208 aa  55.8  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4289  phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 
207 aa  55.8  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.808672 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4657  Phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 
198 aa  55.8  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.2831 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4423  Phosphoglycerate mutase  25.1 
 
 
222 aa  55.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.120144 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  27.4 
 
 
214 aa  53.9  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  26.56 
 
 
197 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  28.02 
 
 
208 aa  54.3  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3452  phosphoglycerate mutase  25 
 
 
200 aa  52.4  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2288  phosphoglycerate mutase  32.73 
 
 
155 aa  52.4  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  26.35 
 
 
378 aa  52  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 
221 aa  50.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  26.06 
 
 
200 aa  50.4  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0435  phosphoglycerate mutase  25.91 
 
 
193 aa  50.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.734689  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0424  phosphoglycerate mutase  25.91 
 
 
193 aa  50.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.845746  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0928  Phosphoglycerate mutase  30.17 
 
 
201 aa  49.7  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  26.06 
 
 
200 aa  50.4  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  26.87 
 
 
207 aa  49.7  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  26.79 
 
 
200 aa  48.5  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  27.2 
 
 
209 aa  48.9  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3241  phosphoglycerate mutase family protein  30.89 
 
 
196 aa  48.1  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0777453  normal  0.210221 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  25 
 
 
205 aa  48.1  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  33.7 
 
 
197 aa  47.8  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  24.27 
 
 
233 aa  47.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  23.98 
 
 
203 aa  47  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3550  fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  28.46 
 
 
316 aa  47.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1756  phosphoglycerate mutase-like protein  30.15 
 
 
219 aa  47.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.14183 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  23.9 
 
 
210 aa  47  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  22.61 
 
 
214 aa  47.4  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  28.81 
 
 
200 aa  47.4  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2175  phosphoglycerate mutase family protein  25.12 
 
 
196 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.778045  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  23.95 
 
 
378 aa  46.2  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  28.93 
 
 
212 aa  47  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  25.37 
 
 
253 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  30.36 
 
 
200 aa  45.8  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1583  phosphoglycerate mutase  28.21 
 
 
216 aa  46.2  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0769  phosphoglycerate mutase  37.97 
 
 
197 aa  45.8  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.578842  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  26.47 
 
 
213 aa  45.4  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.01 
 
 
197 aa  45.8  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0155  phosphoglycerate mutase family protein  33.62 
 
 
201 aa  45.8  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0847237  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0334  Phosphoglycerate mutase  33.62 
 
 
201 aa  45.8  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.382121 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2066  phosphoglycerate mutase family protein  30.08 
 
 
196 aa  45.8  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 
193 aa  45.8  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  27.55 
 
 
201 aa  45.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  23.58 
 
 
213 aa  45.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  21.78 
 
 
212 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0181  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30 
 
 
266 aa  45.1  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  25.93 
 
 
212 aa  45.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  22.97 
 
 
240 aa  45.1  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  25.93 
 
 
212 aa  45.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2273  Phosphoglycerate mutase  28.4 
 
 
232 aa  44.7  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000488437  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1760  phosphoglycerate mutase family protein  26.47 
 
 
199 aa  44.3  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000115709  normal  0.449804 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  22.71 
 
 
225 aa  44.7  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0606  phosphoglycerate mutase  26.56 
 
 
218 aa  44.3  0.01  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  25.76 
 
 
213 aa  44.3  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1302  Phosphoglycerate mutase  32.2 
 
 
245 aa  44.3  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106982  decreased coverage  0.000409559 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>