More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4657 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4657  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 198 aa  387  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.2831 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4289  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 207 aa  387  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.808672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  93.43 
 
 		 198 aa  365  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5528  phosphoglycerate mutase  72.02 
 
 		 195 aa  251  6e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00985867 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  61.66 
 
 		 197 aa  220  9e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  60.62 
 
 		 197 aa  215  4e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  46.46 
 
 		 196 aa  155  4e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1020  phosphoglycerate mutase  44.32 
 
 		 196 aa  154  9e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0590  Phosphoglycerate mutase  44.86 
 
 		 196 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0728  phosphoglycerate mutase  42.27 
 
 		 195 aa  149  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  43.98 
 
 		 194 aa  149  3e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0630  Phosphoglycerate mutase  44.32 
 
 		 196 aa  149  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0549473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  44.85 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1393  Phosphoglycerate mutase  45.41 
 
 		 197 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0960696  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  44.56 
 
 		 197 aa  144  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0536  phosphoglycerate mutase  41.67 
 
 		 196 aa  142  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0429  phosphoglycerate mutase family protein  40.62 
 
 		 217 aa  142  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1313  phosphoglycerate mutase  45.13 
 
 		 202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0769  phosphoglycerate mutase  42.63 
 
 		 197 aa  138  6e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.578842  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1141  phosphoglycerate mutase  43.78 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0856  phosphoglycerate mutase  35.86 
 
 		 191 aa  97.4  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  45.96 
 
 		 205 aa  95.9  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 188 aa  91.7  6e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  40.91 
 
 		 212 aa  85.9  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1751  phosphoglycerate mutase  34.92 
 
 		 189 aa  85.5  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0730001  normal  0.102833 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  36.65 
 
 		 195 aa  85.1  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  33.86 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2679  phosphoglycerate mutase  32.95 
 
 		 196 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2515  phosphoglycerate mutase  33.13 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.279517  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  41.57 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2747  phosphoglycerate mutase  30.53 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  32.67 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  27.84 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  36.98 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3691  phosphoglycerate mutase  35.26 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.568516 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  41.57 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  33.67 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  36.53 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  42.07 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  36.53 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2551  Phosphoglycerate mutase  31.65 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  32.31 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  40 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  37.21 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  40.5 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  39.86 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1088  Phosphoglycerate mutase  43.88 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  36.6 
 
 		 205 aa  77.8  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  35.08 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  33.74 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  41.21 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  34.69 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  36.26 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  34.38 
 
 		 220 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  34.52 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  34.01 
 
 		 229 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  36.59 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  33.98 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  34.24 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  38.8 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  36 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4661  phosphoglycerate mutase  35.06 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  34.01 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  38.36 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  34.01 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  27.64 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  27.64 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1107  fructose-2;6-bisphosphatase  32.12 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  34.01 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  34.01 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  28.57 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  36.98 
 
 		 198 aa  72  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0327  phosphoglycerate mutase  32.11 
 
 		 389 aa  72  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  33.73 
 
 		 223 aa  72  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 		 459 aa  72  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  29.57 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  27.23 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 		 213 aa  72  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  38.85 
 
 		 253 aa  71.6  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  34.38 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  28.57 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  35.59 
 
 		 225 aa  71.2  0.000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  30.54 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  29.07 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 214 aa  71.2  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  27.53 
 
 		 210 aa  71.2  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  34.38 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.93 
 
 		 442 aa  71.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  30.22 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68318  fructose-2,6-bisphosphatase (FBP26)  26.4 
 
 		 456 aa  70.1  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.995791  normal  0.428172 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  33.5 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  37.02 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  34.3 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 		 215 aa  70.1  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20020  fructose-2,6-bisphosphatase  34.78 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.286624  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>