More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1516 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1516  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 215 aa  426  1e-118  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.481804 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4423  Phosphoglycerate mutase  38.68 
 
 		 222 aa  141  7e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.120144 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2898  Phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  28.06 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 208 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  35.43 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  32.2 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  30.99 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  34.86 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  29.82 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  32.94 
 
 		 205 aa  75.1  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  28.22 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  31.93 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  28.57 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  30.92 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  30.95 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0724  Phosphoglycerate mutase  27.5 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0153538  normal  0.0816175 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0100  phosphoglycerate mutase family protein  26.92 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  29.48 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3303  phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0078  phosphoglycerate mutase family protein  26.37 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.570626  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.41 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.41 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  34.15 
 
 		 211 aa  72  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  37.42 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  37.42 
 
 		 226 aa  71.2  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  27.33 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  27.17 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  27.17 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0511  6-phosphofructo-2-kinase  28.57 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0606  phosphoglycerate mutase  30.82 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  27.54 
 
 		 240 aa  69.3  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  27.17 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  27.42 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  30.18 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0711  phosphoglycerate mutase  29.3 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1188  phosphoglycerate mutase family protein  26.44 
 
 		 219 aa  68.2  0.00000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0344076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  32.14 
 
 		 213 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 214 aa  67  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  26.04 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2906  Phosphoglycerate mutase  30.6 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.244907 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  26.63 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  34.81 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  25.54 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  31.9 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  28.78 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  33.73 
 
 		 591 aa  65.1  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13280  fructose-2,6-bisphosphatase  34.82 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  37.9 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  27.81 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  32.1 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  25.54 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  32.35 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  32.91 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  27.81 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3506  Phosphoglycerate mutase  32.29 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  23.41 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  32.97 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  29.78 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  34.09 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  30.12 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  28.24 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  23.95 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  29.31 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  29.76 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.99 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.55 
 
 		 442 aa  62.8  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2551  Phosphoglycerate mutase  27.53 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.51 
 
 		 444 aa  62.4  0.000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05980  cytoplasm protein, putative  34.48 
 
 		 605 aa  62.4  0.000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.023684  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.33 
 
 		 365 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.33 
 
 		 365 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.33 
 
 		 365 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  28.4 
 
 		 212 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0084  Phosphoglycerate mutase  27.91 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  33.55 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  30.59 
 
 		 370 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  32.18 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  32.8 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.37 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  31.41 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.99 
 
 		 443 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  26.01 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1322  phosphoglycerate mutase 1 family protein  30.99 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.191359  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1583  phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  30.59 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  36.72 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  29.52 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  27.75 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>