More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2898 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_2898  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
208 aa  437  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  32.68 
 
 
205 aa  107  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
208 aa  105  5e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  32.85 
 
 
200 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  33.97 
 
 
213 aa  102  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  32.37 
 
 
200 aa  101  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  32.37 
 
 
200 aa  99.8  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  32.37 
 
 
200 aa  99.8  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  32.54 
 
 
213 aa  98.6  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  33.17 
 
 
213 aa  98.2  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 
202 aa  97.8  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 
448 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  33.66 
 
 
240 aa  96.7  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  30.58 
 
 
227 aa  96.7  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 
448 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  31.73 
 
 
209 aa  96.7  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  30.77 
 
 
207 aa  94.7  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 
223 aa  94.7  9e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  33.01 
 
 
213 aa  94.7  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 
215 aa  94  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  32.54 
 
 
210 aa  94.4  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.85 
 
 
378 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  33.82 
 
 
240 aa  93.2  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  30.39 
 
 
235 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  31.37 
 
 
224 aa  93.2  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  32.08 
 
 
209 aa  93.2  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 
214 aa  92.8  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 
214 aa  92.4  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  34.45 
 
 
201 aa  92.4  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  34.45 
 
 
201 aa  92.4  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 
226 aa  92  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 
223 aa  91.7  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 
226 aa  91.7  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  30.48 
 
 
220 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  29.76 
 
 
213 aa  91.3  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  30.48 
 
 
220 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  31.63 
 
 
229 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  30.48 
 
 
229 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  31.63 
 
 
220 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  31.63 
 
 
220 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  31.63 
 
 
220 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.58 
 
 
442 aa  89.4  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  30.24 
 
 
233 aa  89.7  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 
237 aa  89.4  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  32.39 
 
 
221 aa  89  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  32.39 
 
 
221 aa  89  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 
220 aa  89  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 
213 aa  89  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  30 
 
 
227 aa  88.6  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  34.58 
 
 
213 aa  88.6  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  31.4 
 
 
205 aa  88.2  9e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  29.52 
 
 
229 aa  87.8  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  30.88 
 
 
223 aa  87.4  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  28.77 
 
 
217 aa  86.7  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  28.29 
 
 
212 aa  86.3  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.1 
 
 
442 aa  86.3  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 
202 aa  86.3  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  28.78 
 
 
228 aa  85.9  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  31.92 
 
 
221 aa  85.9  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
214 aa  84.7  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 
220 aa  84.7  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.73 
 
 
443 aa  84.7  9e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 
214 aa  84.7  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  30 
 
 
447 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  28.93 
 
 
205 aa  84  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.37 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.1 
 
 
442 aa  84.3  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  29.72 
 
 
224 aa  83.6  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  30.66 
 
 
220 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1516  phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.481804 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  31.75 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 
220 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 
224 aa  82.4  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  30.24 
 
 
233 aa  82.4  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  30.19 
 
 
220 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  28.44 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  28.44 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  28.44 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  29.67 
 
 
445 aa  81.6  0.000000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  31.37 
 
 
223 aa  81.6  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  36.25 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 
214 aa  80.9  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  27.88 
 
 
449 aa  80.1  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  30.97 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  26.19 
 
 
459 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  30.73 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  31.14 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2066  phosphoglycerate mutase family protein  28.17 
 
 
196 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  27.18 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  30.43 
 
 
203 aa  79.3  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3303  phosphoglycerate mutase  30.29 
 
 
200 aa  79  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.38 
 
 
442 aa  79  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  28.43 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.19 
 
 
369 aa  78.2  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  32.09 
 
 
206 aa  77.8  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  29.58 
 
 
220 aa  77.4  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  27.42 
 
 
196 aa  77.4  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>