42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0304 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0304  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 222 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.484417  normal  0.3074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0965  Phosphoglycerate mutase  45.36 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564706  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5383  phosphoglycerate mutase family protein  43.46 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4450  phosphoglycerate mutase family protein  38.07 
 
 		 208 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191223 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5116  phosphoglycerate mutase  44.32 
 
 		 209 aa  121  8e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.156451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5585  Phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 209 aa  116  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393552  normal  0.0995735 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3846  phosphoglycerate mutase  35.38 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1844  phosphoglycerate mutase  31.16 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000187954  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  34.33 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  32.3 
 
 		 210 aa  52  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  36.09 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 		 234 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02083  phosphoglycerate mutase family protein, putative  26.42 
 
 		 259 aa  48.9  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.956321  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  31.37 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2210  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.59 
 
 		 191 aa  48.1  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2170  Phosphoglycerate mutase  27.88 
 
 		 244 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00522572  normal  0.0339926 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0724  Phosphoglycerate mutase  27.33 
 
 		 236 aa  47  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0153538  normal  0.0816175 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  29.21 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1846  Phosphoglycerate mutase  27.88 
 
 		 244 aa  45.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  decreased coverage  0.00463993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  30.12 
 
 		 274 aa  45.4  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  31.03 
 
 		 370 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3506  Phosphoglycerate mutase  36.94 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  31.45 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1788  acid phosphatase  32.12 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.498768  normal  0.567504 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  29.15 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3157  phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3219  phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.649085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3169  phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.594827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.41 
 
 		 378 aa  43.1  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3514  phosphoglycerate mutase  25.47 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0342189  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  29.11 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35690  fructose-2,6-bisphosphatase  28.43 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  28.4 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12165  hypothetical protein  33.74 
 
 		 236 aa  43.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3827  Phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 		 224 aa  43.5  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  28.29 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  27.33 
 
 		 209 aa  42.7  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2929  phosphoglycerate mutase  41.56 
 
 		 198 aa  42.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3949  Phosphoglycerate mutase  34.68 
 
 		 232 aa  42.4  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00773926  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  32.05 
 
 		 181 aa  41.6  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  29.27 
 
 		 236 aa  41.6  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13871  phosphoglycerate mutase  31.33 
 
 		 232 aa  41.6  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>