112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2929 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2929  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
198 aa  403  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1836  Phosphoglycerate mutase  40.96 
 
 
205 aa  131  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4549  phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 
200 aa  87.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0522035 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0458  Phosphoglycerate mutase  30.89 
 
 
198 aa  87.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.977628  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2433  Phosphoglycerate mutase  32.63 
 
 
195 aa  86.7  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5148  pgam5; phosphoglycerate mutase family member 5  28.79 
 
 
204 aa  84.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.477375  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0075  Phosphoglycerate mutase  30.57 
 
 
199 aa  75.1  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193041  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  41.03 
 
 
221 aa  60.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  27.09 
 
 
213 aa  60.1  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  39.51 
 
 
213 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17454  predicted protein  28.43 
 
 
291 aa  56.2  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.408947  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  39.51 
 
 
213 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  26.34 
 
 
207 aa  54.7  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  31.19 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0545  Phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 
218 aa  52.4  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000658499 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  28.42 
 
 
200 aa  52  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0965  Phosphoglycerate mutase  26.44 
 
 
231 aa  51.6  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0564706  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  24.48 
 
 
204 aa  50.4  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0344  Phosphoglycerate mutase  36.05 
 
 
219 aa  50.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  30.95 
 
 
213 aa  50.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  24.15 
 
 
216 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.98 
 
 
200 aa  49.3  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.98 
 
 
200 aa  49.3  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  24.02 
 
 
240 aa  49.7  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  26.21 
 
 
207 aa  49.7  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  23.67 
 
 
216 aa  49.3  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0862  putative alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC  25.91 
 
 
200 aa  48.5  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  29.14 
 
 
205 aa  48.1  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  23.56 
 
 
206 aa  48.1  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  40.51 
 
 
442 aa  47.8  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6122  phosphoglycerate mutase  34.57 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.756023  normal  0.910553 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0772  phosphoglycerate mutase  28.33 
 
 
215 aa  47.8  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  26.96 
 
 
209 aa  47.4  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  26.15 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  28.17 
 
 
205 aa  47.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3882  phosphoglycerate mutase  25.51 
 
 
198 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4894  phosphoglycerate mutase  27.35 
 
 
274 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0936935  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_006686  CND04610  hypothetical protein  32.5 
 
 
251 aa  46.2  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  39.51 
 
 
444 aa  46.2  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17595  predicted protein  40 
 
 
498 aa  46.2  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.372053 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  26.9 
 
 
200 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  24.53 
 
 
208 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  23.53 
 
 
203 aa  45.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0586  Phosphoglycerate mutase  45.16 
 
 
193 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427529  normal  0.250428 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1694  Phosphoglycerate mutase  27.32 
 
 
230 aa  45.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.873195  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2012  Phosphoglycerate mutase  23.08 
 
 
190 aa  45.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.759773  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2898  Phosphoglycerate mutase  24.27 
 
 
208 aa  45.1  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0541  Phosphoglycerate mutase  43.55 
 
 
193 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0350967  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  26.14 
 
 
203 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2645  phosphoglycerate mutase  26.01 
 
 
275 aa  45.1  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.13165  normal  0.0421048 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2127  phosphoglycerate mutase  26.64 
 
 
215 aa  45.1  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00711318  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1936  phosphoglycerate mutase  27.44 
 
 
233 aa  45.1  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0170489  normal  0.370052 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
208 aa  45.1  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1266  phosphoglycerate mutase family protein  41.43 
 
 
219 aa  45.1  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  27.35 
 
 
225 aa  45.1  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  25.64 
 
 
224 aa  44.7  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1188  phosphoglycerate mutase family protein  25.24 
 
 
219 aa  44.3  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0344076  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  25.71 
 
 
253 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  44.44 
 
 
213 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  26.09 
 
 
223 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37572  predicted protein  36.47 
 
 
977 aa  44.3  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.421794  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3985  Phosphoglycerate mutase  26.32 
 
 
212 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.634777 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  36 
 
 
203 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  35.8 
 
 
448 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  25 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0934  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.18 
 
 
215 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  26.37 
 
 
445 aa  43.5  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2906  Phosphoglycerate mutase  26.04 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.244907 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3482  phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 
234 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00747944  normal  0.39412 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  28.89 
 
 
235 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  44.44 
 
 
241 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0838  phosphoglycerate mutase  23.88 
 
 
219 aa  43.5  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000172405  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1833  Phosphoglycerate mutase  45.45 
 
 
245 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.143224 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  24.84 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4794  phosphoglycerate mutase  26.2 
 
 
184 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  24.75 
 
 
214 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0116  Phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 
221 aa  43.5  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128968  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  27.27 
 
 
382 aa  43.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3044  phosphoglycerate mutase  40.3 
 
 
230 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  26.02 
 
 
200 aa  42.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  33.75 
 
 
194 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  27.45 
 
 
207 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  28.83 
 
 
214 aa  43.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1696  Phosphoglycerate mutase  34.15 
 
 
402 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  34.67 
 
 
203 aa  43.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00790  phosphohistidine phosphatase SixA  35.63 
 
 
439 aa  43.1  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  23.39 
 
 
214 aa  42.7  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  38.81 
 
 
235 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0238  phosphoglycerate mutase  30.86 
 
 
402 aa  42.7  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2594  phosphoglycerate mutase  36.47 
 
 
240 aa  42.4  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.440152  normal  0.139098 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  24.65 
 
 
245 aa  42.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0304  phosphoglycerate mutase  41.56 
 
 
222 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.484417  normal  0.3074 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1926  phosphoglycerate mutase  26.63 
 
 
196 aa  42.7  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00641926  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  23.89 
 
 
198 aa  42.4  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6718  Phosphoglycerate mutase  30.59 
 
 
209 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0773  phosphoglycerate mutase  26.11 
 
 
205 aa  42.4  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.880145  normal  0.0308619 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13280  fructose-2,6-bisphosphatase  30.63 
 
 
208 aa  42.4  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2228  phosphoglycerate mutase  28.22 
 
 
227 aa  42  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2243  phosphoglycerate mutase  42.67 
 
 
195 aa  42  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0303  putative phosphohistidine phosphatase, SixA  38.96 
 
 
146 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>