More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2228 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2228  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 227 aa  454  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2906  Phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 		 219 aa  137  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.244907 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1926  phosphoglycerate mutase  35.75 
 
 		 196 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00641926  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2175  phosphoglycerate mutase family protein  35.44 
 
 		 196 aa  109  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.778045  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2160  phosphoglycerate mutase family protein  35.44 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1929  phosphoglycerate mutase family protein  35.44 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2076  phosphoglycerate mutase family protein  35.44 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2107  phosphoglycerate mutase family protein  35.44 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1881  phosphoglycerate mutase  35.44 
 
 		 196 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3241  phosphoglycerate mutase family protein  34.95 
 
 		 196 aa  106  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0777453  normal  0.210221 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1891  phosphoglycerate mutase  34.95 
 
 		 196 aa  105  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2066  phosphoglycerate mutase family protein  33.17 
 
 		 196 aa  99.8  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3303  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 200 aa  91.7  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1608  Phosphoglycerate mutase  40.36 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  33.02 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  33.33 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  37.58 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  33.49 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0562  phosphoglycerate mutase  40.85 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434916 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  31.71 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  33.7 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  32.54 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  35.19 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  32.75 
 
 		 224 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  35.44 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  29.33 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  33.93 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 		 225 aa  68.9  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0245  phosphoglycerate mutase  35.43 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.044549 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2898  Phosphoglycerate mutase  26.92 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.65 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1322  phosphoglycerate mutase 1 family protein  36 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.191359  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  32.5 
 
 		 253 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.74 
 
 		 442 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  34.55 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  29.36 
 
 		 459 aa  66.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0267  Phosphoglycerate mutase  35.67 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0998048 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  34.55 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  33.55 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1520  phosphoglycerate mutase 1 family  35.43 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0824  phosphoglycerate mutase  30.23 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.433176  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  33.93 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0841  phosphoglycerate mutase  30.23 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.286074  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1188  phosphoglycerate mutase family protein  28.18 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0344076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  31.55 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0739  phosphoglycerate mutase  32.94 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.374584  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.32 
 
 		 442 aa  65.1  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  34.36 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  29.38 
 
 		 447 aa  65.1  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  33.7 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  34.52 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  34.57 
 
 		 235 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2156  Phosphoglycerate mutase  32.24 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  36.97 
 
 		 366 aa  65.1  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 		 251 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  29.87 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  33.94 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  29.87 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  33.94 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.47 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  33.94 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  28.64 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  33.94 
 
 		 220 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0998  Phosphoglycerate mutase  25.37 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  37.89 
 
 		 363 aa  63.2  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  38.69 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  33.16 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  33.97 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1152  phosphoglycerate mutase 1 family  31.55 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  26.67 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2108  fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  28.31 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.317681  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1513  phosphoribosyltransferase, putative/phosphoglycerate mutase family protein  28.25 
 
 		 438 aa  62.8  0.000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000537342 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  34.57 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0202  phosphoglyceromutase  36.27 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.594301 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0290  phosphoglycerate mutase  33.9 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.438239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  36.47 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  38.55 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  35.53 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.58 
 
 		 369 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0444  phosphoglyceromutase  33.72 
 
 		 208 aa  62  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.114535  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3570  phosphoglyceromutase  30.36 
 
 		 210 aa  62  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0578  phosphoglycerate mutase 1 family  32.16 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  33.72 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  30.1 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  32.92 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  32.92 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0476  phosphoglycerate mutase family protein  29.51 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00558818  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  34.76 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0159  phosphoglyceromutase  36.27 
 
 		 207 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>