More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3334 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 366 aa  712    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  53.85 
 
 		 378 aa  316  5e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  50.27 
 
 		 378 aa  294  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  51.5 
 
 		 378 aa  292  7e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  51.24 
 
 		 363 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  45.76 
 
 		 401 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  47.73 
 
 		 382 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  47.28 
 
 		 369 aa  276  4e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 370 aa  276  6e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  47.54 
 
 		 356 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  45.26 
 
 		 383 aa  266  4e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  46.72 
 
 		 365 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  46.72 
 
 		 365 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  46.72 
 
 		 365 aa  264  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  42.61 
 
 		 411 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  47.55 
 
 		 391 aa  254  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  43.1 
 
 		 412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  47.72 
 
 		 402 aa  237  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  46.3 
 
 		 364 aa  226  4e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  66.44 
 
 		 452 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  63.92 
 
 		 322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  67.69 
 
 		 427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  66.21 
 
 		 440 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  41.2 
 
 		 243 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  62.41 
 
 		 137 aa  143  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  63.93 
 
 		 412 aa  143  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  42.57 
 
 		 218 aa  128  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  38.69 
 
 		 215 aa  108  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  35.79 
 
 		 235 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3671  phosphoglycerate mutase  37.24 
 
 		 207 aa  107  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.786994  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  43.38 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  37.7 
 
 		 214 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  31.75 
 
 		 209 aa  104  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  50.74 
 
 		 133 aa  103  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  38.76 
 
 		 226 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  38.76 
 
 		 226 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  43.08 
 
 		 253 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  43.08 
 
 		 253 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  34.93 
 
 		 224 aa  99.4  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  42.31 
 
 		 168 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  37.57 
 
 		 205 aa  96.3  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  40.44 
 
 		 222 aa  96.3  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  40.44 
 
 		 222 aa  96.3  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  44.09 
 
 		 132 aa  95.9  9e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  39.51 
 
 		 227 aa  94.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  37.58 
 
 		 229 aa  94.4  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  37.16 
 
 		 253 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  44.29 
 
 		 197 aa  93.2  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  31.69 
 
 		 211 aa  91.3  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0088  ribonuclease H  41.1 
 
 		 211 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  30.65 
 
 		 208 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  31.89 
 
 		 212 aa  89.4  9e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.52 
 
 		 201 aa  88.2  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4219  ribonuclease H  35.97 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  39.52 
 
 		 198 aa  87.4  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  34.57 
 
 		 215 aa  87.4  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  34.27 
 
 		 209 aa  87.4  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  26.88 
 
 		 206 aa  87.8  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 201 aa  87.4  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  30.05 
 
 		 201 aa  87.4  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1173  ribonuclease H  36.09 
 
 		 194 aa  87  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2249  Phosphoglycerate mutase  37.06 
 
 		 234 aa  87  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  28.43 
 
 		 209 aa  86.3  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 		 201 aa  86.3  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3570  phosphoglyceromutase  33.15 
 
 		 210 aa  85.9  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  34.29 
 
 		 210 aa  86.3  9e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  34.95 
 
 		 215 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  30.26 
 
 		 205 aa  85.5  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  34.95 
 
 		 215 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  34.95 
 
 		 215 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  30.96 
 
 		 200 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  37.72 
 
 		 210 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0341  ribonuclease H  42.86 
 
 		 142 aa  85.5  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5934  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  34.57 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0331503 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 213 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_8015  predicted protein  40.16 
 
 		 126 aa  84.7  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00418489  normal  0.339866 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1760  phosphoglycerate mutase family protein  32.52 
 
 		 199 aa  84.3  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000115709  normal  0.449804 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  41.51 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  39.05 
 
 		 215 aa  84.3  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  28.96 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12100  fructose-2,6-bisphosphatase  38.37 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0451501  normal  0.0684118 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  27.66 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2506  phosphoglyceromutase  31.82 
 
 		 212 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.428069  normal  0.0792311 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2729  phosphoglyceromutase  31.82 
 
 		 212 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  0.228083 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2434  phosphoglyceromutase  31.82 
 
 		 212 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 		 233 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  32.49 
 
 		 213 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2273  Phosphoglycerate mutase  39.39 
 
 		 232 aa  81.6  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000488437  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 200 aa  82  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  31.02 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2680  phosphoglycerate mutase 1 family  33.33 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  30.85 
 
 		 200 aa  81.3  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0309  ribonuclease H  44.6 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0444  phosphoglyceromutase  33.33 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.114535  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  31.38 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1437  ribonuclease H  34.59 
 
 		 134 aa  80.5  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0729  phosphoglycerate mutase  30.85 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000243184 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1239  alpha-ribazole phosphatase  33.33 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.670412  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>