More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND04610 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND04610  hypothetical protein  100 
 
 
251 aa  521  1e-147  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  43.33 
 
 
221 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  45.56 
 
 
444 aa  75.9  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  46.67 
 
 
442 aa  75.1  0.0000000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  41.76 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  41.24 
 
 
448 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  38.78 
 
 
459 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  41.24 
 
 
448 aa  73.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 
204 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  32.62 
 
 
447 aa  72.8  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  41.76 
 
 
445 aa  71.2  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  33.59 
 
 
194 aa  71.2  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  41.11 
 
 
442 aa  70.1  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.11 
 
 
442 aa  69.3  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3374  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.822383  normal  0.0226984 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  41.57 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  27.93 
 
 
214 aa  65.9  0.0000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0116  Phosphoglycerate mutase  28.86 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.128968  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  39.56 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  33.8 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0545  Phosphoglycerate mutase  40.66 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000658499 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  29.17 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34127  putative phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.375403 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  40 
 
 
214 aa  65.5  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  42.55 
 
 
205 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  37.78 
 
 
213 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1760  phosphoglycerate mutase family protein  30.61 
 
 
199 aa  65.1  0.000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000115709  normal  0.449804 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  40.74 
 
 
192 aa  65.1  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  39.8 
 
 
452 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.55 
 
 
449 aa  63.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.52 
 
 
442 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07531  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.03 
 
 
547 aa  63.5  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.97 
 
 
442 aa  63.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  28.72 
 
 
220 aa  63.2  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  38.89 
 
 
213 aa  63.2  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  29.2 
 
 
209 aa  62.8  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3466  Phosphoglycerate mutase  29.17 
 
 
253 aa  62.8  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  29.21 
 
 
202 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  28.12 
 
 
214 aa  62  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  30.81 
 
 
196 aa  62  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.287698 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  41.11 
 
 
212 aa  62  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  38.89 
 
 
443 aa  62.4  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  37.08 
 
 
207 aa  62  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  29.7 
 
 
202 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  29.55 
 
 
189 aa  62  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  29.7 
 
 
213 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  37.78 
 
 
213 aa  62  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.06 
 
 
442 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0513  phosphoglycerate mutase  36.62 
 
 
194 aa  61.6  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0695  phosphoglycerate mutase family protein  28.94 
 
 
217 aa  61.6  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.597978  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  37.25 
 
 
212 aa  61.2  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  29.7 
 
 
202 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  40 
 
 
207 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  36.26 
 
 
213 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  37.78 
 
 
214 aa  60.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  31.01 
 
 
209 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  41.57 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  32.17 
 
 
197 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  37.96 
 
 
205 aa  60.5  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1203  phosphoglycerate mutase  35.56 
 
 
190 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  35.42 
 
 
214 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0300  Phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 
197 aa  60.5  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  25.9 
 
 
221 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  27.09 
 
 
221 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  36.67 
 
 
213 aa  60.1  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  38.89 
 
 
207 aa  60.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  27.09 
 
 
221 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  34.51 
 
 
224 aa  60.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  35.42 
 
 
214 aa  60.1  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2469  putative phosphoglycerate mutase  29.53 
 
 
199 aa  59.7  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3674  phosphoglycerate mutase  23.58 
 
 
216 aa  59.7  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  34.38 
 
 
447 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.72 
 
 
203 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  27.72 
 
 
203 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  27.34 
 
 
208 aa  59.3  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  27.72 
 
 
203 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  27.72 
 
 
203 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  31.89 
 
 
205 aa  59.3  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  26.81 
 
 
370 aa  59.3  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  28.71 
 
 
202 aa  59.3  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  35.19 
 
 
203 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  35.87 
 
 
217 aa  59.3  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  35.19 
 
 
203 aa  59.3  0.00000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.55 
 
 
442 aa  59.3  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  32.86 
 
 
222 aa  58.9  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  32.86 
 
 
222 aa  58.9  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  36.67 
 
 
214 aa  58.9  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 
223 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  36.67 
 
 
214 aa  58.9  0.00000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3955  phosphoglycerate mutase  28.67 
 
 
240 aa  58.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0124021 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 
190 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 
216 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5270  phosphoglycerate mutase  29.69 
 
 
225 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.851193  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0567  phosphoglycerate mutase  25.2 
 
 
216 aa  58.5  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.350185  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1188  phosphoglycerate mutase family protein  27.24 
 
 
219 aa  58.2  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0344076  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0382  phosphoglycerate mutase family protein  38.04 
 
 
218 aa  58.5  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000714196  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  30.56 
 
 
197 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0728  phosphoglycerate mutase  30.99 
 
 
195 aa  57.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
197 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  28.47 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>