More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_34127 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_34127  putative phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 225 aa  461  1e-129  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.375403 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  28.19 
 
 		 459 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  29.33 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  27.23 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  26.15 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  27.75 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  28.91 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  27.11 
 
 		 449 aa  74.7  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  27.61 
 
 		 452 aa  74.7  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  26.98 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  27.52 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  27.65 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  27.23 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  27.19 
 
 		 226 aa  70.9  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  28.05 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  25.23 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  26.7 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  26.7 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  26.85 
 
 		 445 aa  70.1  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  26.7 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  27.48 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  26.7 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  26.7 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  32.91 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  27.23 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  27.83 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  28.97 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  26.29 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  34.65 
 
 		 249 aa  68.6  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  26.24 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  26.24 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  26.24 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  26.24 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  26.24 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  26.24 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  26.24 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0739  phosphoglycerate mutase  29.03 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.374584  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  26.24 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  26.85 
 
 		 215 aa  68.2  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.37 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.37 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  27.92 
 
 		 208 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  25.93 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1881  Phosphoglycerate mutase  28.77 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  28.75 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2980  phosphoglycerate mutase  33.12 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  27.74 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0695  phosphoglycerate mutase family protein  26.64 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.597978  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  25.34 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  28.5 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  25.82 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04610  hypothetical protein  38.46 
 
 		 251 aa  65.5  0.0000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  24.89 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  28.37 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  28.92 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  25.57 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3085  Phosphoglycerate mutase  32.5 
 
 		 205 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.115286  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  29.5 
 
 		 447 aa  64.7  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.73 
 
 		 444 aa  63.5  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  27.61 
 
 		 203 aa  64.3  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  26.85 
 
 		 213 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  26.27 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  23.22 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  22.62 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3868  phosphoglycerate mutase  29.03 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000990207  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  26.36 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  28.47 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  30.28 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2698  phosphoglycerate mutase  26.03 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.32804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  26.42 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.22 
 
 		 442 aa  62.4  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  26.15 
 
 		 447 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  25.45 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07531  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.77 
 
 		 547 aa  62.4  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0536  phosphoglycerate mutase  32.56 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  24.29 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  27.22 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  25.66 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  31 
 
 		 207 aa  62  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0590  Phosphoglycerate mutase  31.21 
 
 		 196 aa  62  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  27.31 
 
 		 448 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0567  phosphoglycerate mutase  23.98 
 
 		 216 aa  62  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.350185  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  27.31 
 
 		 448 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  24.88 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  27.74 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1203  phosphoglycerate mutase  41.57 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  25.23 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  28.9 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  28.9 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  28.9 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.56 
 
 		 442 aa  61.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  26.42 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  25.91 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>