More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_23210 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  100 
 
 
189 aa  392  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  36.11 
 
 
204 aa  105  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  31.75 
 
 
222 aa  94.7  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  31.75 
 
 
222 aa  94.7  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  34.43 
 
 
205 aa  94.4  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12420  fructose-2,6-bisphosphatase  34.9 
 
 
214 aa  94.4  8e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.976042  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 
190 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1203  phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 
190 aa  93.2  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2637  phosphoglycerate mutase  31.45 
 
 
190 aa  90.1  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00707522  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  30.11 
 
 
213 aa  87.8  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  29.24 
 
 
203 aa  87.4  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3981  phosphoglycerate mutase family protein  32.7 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181997  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3846  phosphoglycerate mutase family protein  32.7 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000331625  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3677  phosphoglycerate mutase family protein  32.7 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3694  phosphoglycerate mutase family protein  33.33 
 
 
192 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0148524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4049  phosphoglycerate mutase family protein  32.7 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00510516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4144  phosphoglycerate mutase family protein  32.7 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  30.51 
 
 
207 aa  87  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3949  phosphoglycerate mutase family protein  32.7 
 
 
192 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3610  phosphoglycerate mutase  33.96 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3480  phosphoglycerate mutase  33.96 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3761  phosphoglycerate mutase  34.18 
 
 
190 aa  84  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.300708  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 
213 aa  84  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0813  phosphoglycerate mutase  33.96 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  33.55 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  28.12 
 
 
208 aa  82  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  26.23 
 
 
196 aa  82  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  33.51 
 
 
211 aa  81.6  0.000000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1751  phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 
189 aa  81.3  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0730001  normal  0.102833 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  31.84 
 
 
207 aa  81.6  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0300  Phosphoglycerate mutase  47.13 
 
 
197 aa  81.3  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 
198 aa  80.9  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  30.6 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  34.73 
 
 
188 aa  79.7  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  31.28 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0062  phosphoglycerate mutase  34.87 
 
 
207 aa  79.7  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  26.04 
 
 
207 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  39.82 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  27.51 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  36.77 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  33.97 
 
 
194 aa  79.3  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  32.08 
 
 
215 aa  78.6  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0369  phosphoglycerate mutase  31.25 
 
 
200 aa  78.2  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  32.89 
 
 
370 aa  78.2  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  32.05 
 
 
213 aa  77.8  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  26.55 
 
 
208 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  33.72 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1026  Phosphoglycerate mutase  29.63 
 
 
212 aa  77  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.411321  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  30.95 
 
 
253 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  34.46 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  33.97 
 
 
208 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  28.8 
 
 
205 aa  76.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  29.03 
 
 
203 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  31.74 
 
 
198 aa  76.3  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2679  phosphoglycerate mutase  36.31 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.446452  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2747  phosphoglycerate mutase  36.31 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04271  phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3602  Phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3661  phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4631  phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4995  phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4947  phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04236  hypothetical protein  29.56 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4944  phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5911  phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 
215 aa  75.1  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2605  phosphoglycerate mutase family protein  29.61 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  28.43 
 
 
240 aa  75.1  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  31.17 
 
 
196 aa  75.1  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  34.01 
 
 
200 aa  74.7  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  42.35 
 
 
194 aa  74.7  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  29.03 
 
 
203 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  34.59 
 
 
221 aa  74.3  0.0000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2908  Phosphoglycerate mutase  33.94 
 
 
219 aa  74.3  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.87 
 
 
443 aa  73.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0541  Phosphoglycerate mutase  33.8 
 
 
193 aa  73.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0350967  normal  0.247092 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  30.82 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  30.82 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  30.82 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  30.82 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  30.82 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  40.48 
 
 
226 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  40.48 
 
 
226 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  27.74 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  28.12 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  31.28 
 
 
445 aa  73.6  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  31.61 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  31.65 
 
 
235 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  28.89 
 
 
209 aa  73.6  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3224  Phosphoglycerate mutase  29.32 
 
 
191 aa  73.2  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.12947  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 
224 aa  73.6  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0590  Phosphoglycerate mutase  34.25 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.57208  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  29.68 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.77 
 
 
378 aa  72.8  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1760  phosphoglycerate mutase family protein  30.49 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000115709  normal  0.449804 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  28.48 
 
 
208 aa  72.8  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  27.74 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>