25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4549 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4549  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 200 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0522035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5148  pgam5; phosphoglycerate mutase family member 5  72.06 
 
 		 204 aa  300  1e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.477375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0075  Phosphoglycerate mutase  70.5 
 
 		 199 aa  259  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193041  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0458  Phosphoglycerate mutase  62.63 
 
 		 198 aa  230  1e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.977628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2433  Phosphoglycerate mutase  61.03 
 
 		 195 aa  226  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2012  Phosphoglycerate mutase  41.58 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.759773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1836  Phosphoglycerate mutase  32.83 
 
 		 205 aa  94.4  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2929  phosphoglycerate mutase  31.61 
 
 		 198 aa  87.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17454  predicted protein  28.04 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.408947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  26.92 
 
 		 209 aa  51.2  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.77 
 
 		 427 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  25.69 
 
 		 208 aa  48.1  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  29.21 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  31.78 
 
 		 221 aa  47.4  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  27.74 
 
 		 207 aa  45.4  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37201  predicted protein  26.86 
 
 		 311 aa  45.4  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0695  phosphoglycerate mutase family protein  24.06 
 
 		 217 aa  45.1  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.597978  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  26.63 
 
 		 213 aa  45.1  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3338  phosphoglycerate mutase  28 
 
 		 235 aa  43.9  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000263066  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  27.32 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0633  phosphoglycerate mutase  27.71 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  27.17 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3949  Phosphoglycerate mutase  27.96 
 
 		 232 aa  42  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00773926  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  25.49 
 
 		 214 aa  41.6  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  26.36 
 
 		 235 aa  41.6  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>