52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2012 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2012  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 190 aa  371  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.759773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0075  Phosphoglycerate mutase  43.62 
 
 		 199 aa  118  6e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4549  phosphoglycerate mutase  41.58 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0522035 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5148  pgam5; phosphoglycerate mutase family member 5  41.15 
 
 		 204 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.477375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2433  Phosphoglycerate mutase  40.64 
 
 		 195 aa  104  8e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0458  Phosphoglycerate mutase  40.64 
 
 		 198 aa  96.7  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.977628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1836  Phosphoglycerate mutase  34.5 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  29.05 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  26.37 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  22.37 
 
 		 233 aa  52.4  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  24.62 
 
 		 447 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  28.57 
 
 		 205 aa  51.6  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.71 
 
 		 427 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  27.59 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  23.79 
 
 		 207 aa  48.9  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  26.79 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  28.49 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  24.37 
 
 		 209 aa  45.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  27.23 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  30.82 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2929  phosphoglycerate mutase  23.08 
 
 		 198 aa  45.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  24.26 
 
 		 213 aa  45.4  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09860  phosphohistidine phosphatase SixA  38.79 
 
 		 169 aa  45.4  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.48313  normal  0.0870397 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  22.82 
 
 		 207 aa  44.7  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  22.04 
 
 		 215 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  22.04 
 
 		 215 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  22.04 
 
 		 215 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  22.04 
 
 		 215 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  22.04 
 
 		 215 aa  44.7  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  28.92 
 
 		 202 aa  44.7  0.0009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  21.67 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  31.65 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  23.4 
 
 		 448 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  23.4 
 
 		 448 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2898  Phosphoglycerate mutase  25.53 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  37.66 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0773  phosphoglycerate mutase  38.46 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.880145  normal  0.0308619 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  24.15 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  24.7 
 
 		 210 aa  42.7  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3338  phosphoglycerate mutase  25.17 
 
 		 235 aa  43.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000263066  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2822  Phosphoglycerate mutase  32.67 
 
 		 223 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0567  phosphoglycerate mutase  26.09 
 
 		 216 aa  42  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.350185  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.85 
 
 		 442 aa  42  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03117  hypothetical protein  27.27 
 
 		 154 aa  41.6  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0556  phosphoglycerate mutase  22.99 
 
 		 215 aa  42  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  25.7 
 
 		 220 aa  41.6  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  22.33 
 
 		 207 aa  41.6  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  24.39 
 
 		 200 aa  41.6  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  24.39 
 
 		 200 aa  41.6  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  24.64 
 
 		 201 aa  41.2  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  24.64 
 
 		 201 aa  41.2  0.01  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  24.51 
 
 		 444 aa  41.2  0.01  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>