More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2243 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2243  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 195 aa  394  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1676  Phosphoglycerate mutase  67.02 
 
 		 203 aa  257  8e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal  0.436187 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1396  Phosphoglycerate mutase  66.49 
 
 		 203 aa  252  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0105349  normal  0.20859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1401  phosphoglycerate mutase  67.02 
 
 		 225 aa  247  9e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2672  phosphoglycerate mutase  40.66 
 
 		 176 aa  105  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92911  predicted protein  34.48 
 
 		 276 aa  96.3  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.846353  normal  0.142563 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0133  Phosphoglycerate mutase  39.67 
 
 		 180 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333661  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0137  phosphoglycerate mutase  35.98 
 
 		 184 aa  90.1  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11759  predicted protein  32.58 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17595  predicted protein  29.76 
 
 		 498 aa  74.3  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.372053 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37519  predicted protein  31.36 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_6725  predicted protein  31.13 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01873  conserved hypothetical protein  30.51 
 
 		 372 aa  62  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  36.72 
 
 		 442 aa  61.6  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 452 aa  60.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  29.88 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  30.16 
 
 		 459 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22821  predicted protein  32.98 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  43.48 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.47 
 
 		 378 aa  58.9  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  36.28 
 
 		 442 aa  58.9  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.38 
 
 		 442 aa  58.2  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30 
 
 		 442 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  43.48 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46353  predicted protein  26.47 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1760  phosphoglycerate mutase family protein  29.5 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000115709  normal  0.449804 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35517  predicted protein  32.22 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0923281 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00820  conserved hypothetical protein  29.57 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  29.82 
 
 		 442 aa  56.2  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  37.76 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  36.04 
 
 		 442 aa  55.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  28.88 
 
 		 449 aa  55.5  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2929  phosphoglycerate mutase  42.67 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  30.06 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.54 
 
 		 378 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2898  Phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 448 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  30.51 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32390  predicted protein  29.76 
 
 		 266 aa  54.3  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  30.51 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 448 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  30.51 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  28.89 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.44 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.44 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  33.61 
 
 		 445 aa  53.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35.14 
 
 		 443 aa  53.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  29.44 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3403  aminotransferase class I and II  43.9 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0624643  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.7 
 
 		 442 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0628  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.16 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.190097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  42.53 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  41.56 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  39.19 
 
 		 382 aa  52.4  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  33.94 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  37.68 
 
 		 228 aa  52.4  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  28.27 
 
 		 221 aa  52  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1837  phosphoglycerate mutase  38.57 
 
 		 217 aa  52  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  28.72 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9956  predicted protein  27.41 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.841338  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  33.13 
 
 		 210 aa  51.2  0.000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  35.78 
 
 		 213 aa  51.2  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0350  Phosphoglycerate mutase  29.82 
 
 		 405 aa  51.2  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  30.25 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  32.43 
 
 		 253 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40176  predicted protein  28.87 
 
 		 306 aa  50.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  42.86 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  32.41 
 
 		 447 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0112  Phosphoglycerate mutase  35.58 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  39.73 
 
 		 207 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  30.51 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  36.54 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  33.02 
 
 		 447 aa  49.7  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0444  phosphoglyceromutase  41.98 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.114535  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1756  phosphoglycerate mutase-like protein  40.3 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.14183 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  35.45 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3924  phosphoglycerate mutase  29.01 
 
 		 225 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  42.65 
 
 		 203 aa  48.9  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  31.1 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  25.77 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3230  phosphoglycerate mutase  42.53 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  41.43 
 
 		 233 aa  49.3  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0382  phosphoglycerate mutase family protein  31.94 
 
 		 218 aa  48.9  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000714196  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  34.55 
 
 		 370 aa  49.3  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  28.8 
 
 		 214 aa  48.9  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  29.17 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0773  phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.880145  normal  0.0308619 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0435  putative phosphoglycerate mutase family protein  31.31 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  37.38 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0239  phosphoglycerate mutase  24.61 
 
 		 218 aa  48.5  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  30.29 
 
 		 198 aa  48.5  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0251  phosphoglycerate mutase family protein  36.84 
 
 		 223 aa  48.5  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1877  phosphoglycerate mutase  45.45 
 
 		 237 aa  48.5  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  33.64 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2319  phosphoglycerate mutase  43.48 
 
 		 238 aa  48.5  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  30.18 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  33.98 
 
 		 230 aa  48.1  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0122  phosphoglycerate mutase  42.47 
 
 		 237 aa  48.1  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>