16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_46353 on replicon NC_011678
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011678  PHATRDRAFT_46353  predicted protein  100 
 
 
296 aa  604  9.999999999999999e-173  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40176  predicted protein  32.24 
 
 
306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92911  predicted protein  26.32 
 
 
276 aa  87  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.846353  normal  0.142563 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1396  Phosphoglycerate mutase  27.66 
 
 
203 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0105349  normal  0.20859 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00820  conserved hypothetical protein  28.16 
 
 
234 aa  53.9  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1676  Phosphoglycerate mutase  26.81 
 
 
203 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal  0.436187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1401  phosphoglycerate mutase  27.04 
 
 
225 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0118835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2672  phosphoglycerate mutase  26.23 
 
 
176 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0133  Phosphoglycerate mutase  27.49 
 
 
180 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333661  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11759  predicted protein  22.69 
 
 
197 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2243  phosphoglycerate mutase  26.27 
 
 
195 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01873  conserved hypothetical protein  26.92 
 
 
372 aa  46.6  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17595  predicted protein  20.98 
 
 
498 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.372053 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32390  predicted protein  23.77 
 
 
266 aa  44.3  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
201 aa  43.5  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
201 aa  43.5  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>