150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1401 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1401  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 225 aa  457  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118835 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1676  Phosphoglycerate mutase  98.03 
 
 		 203 aa  410  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal  0.436187 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1396  Phosphoglycerate mutase  92.12 
 
 		 203 aa  391  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0105349  normal  0.20859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2243  phosphoglycerate mutase  67.38 
 
 		 195 aa  239  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0137  phosphoglycerate mutase  37.97 
 
 		 184 aa  101  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92911  predicted protein  36.68 
 
 		 276 aa  96.3  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.846353  normal  0.142563 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2672  phosphoglycerate mutase  37.85 
 
 		 176 aa  95.5  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17595  predicted protein  29.86 
 
 		 498 aa  91.3  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.372053 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0133  Phosphoglycerate mutase  39.43 
 
 		 180 aa  89  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333661  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11759  predicted protein  32.61 
 
 		 197 aa  71.2  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32390  predicted protein  30.86 
 
 		 266 aa  62  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.14 
 
 		 442 aa  58.9  0.00000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01873  conserved hypothetical protein  28.26 
 
 		 372 aa  58.5  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.51 
 
 		 442 aa  57.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 213 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37519  predicted protein  29.03 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_6725  predicted protein  27.83 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.09 
 
 		 378 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.02 
 
 		 378 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.63 
 
 		 443 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.14 
 
 		 442 aa  52.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46353  predicted protein  26.58 
 
 		 296 aa  52.4  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  30.56 
 
 		 459 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1664  phosphoglycerate mutase  29.01 
 
 		 225 aa  52  0.000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  38.75 
 
 		 221 aa  51.6  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  28.07 
 
 		 452 aa  51.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  40 
 
 		 442 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  24.86 
 
 		 442 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35 
 
 		 442 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.07 
 
 		 442 aa  51.2  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  27.38 
 
 		 449 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40176  predicted protein  29.54 
 
 		 306 aa  49.7  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 242 aa  49.3  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 		 245 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1756  phosphoglycerate mutase-like protein  34.21 
 
 		 219 aa  48.5  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.14183 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  27.91 
 
 		 211 aa  48.5  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  26.92 
 
 		 200 aa  48.5  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9956  predicted protein  29.01 
 
 		 200 aa  48.5  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.841338  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.09 
 
 		 444 aa  47.8  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  29.36 
 
 		 447 aa  47.8  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5140  Phosphoglycerate mutase  42.65 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.17 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.17 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  33.71 
 
 		 448 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  31.35 
 
 		 445 aa  47  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  33.71 
 
 		 448 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  41.54 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  40.51 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  28.04 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1877  phosphoglycerate mutase  45.45 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  29.88 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  25.68 
 
 		 200 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0095  phosphoglyceromutase  27.97 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.597303  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  28.39 
 
 		 447 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  29.41 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2861  phosphoglyceromutase  35.53 
 
 		 250 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.187742  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2319  phosphoglycerate mutase  44.44 
 
 		 238 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235645 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1407  phosphoglyceromutase  35.53 
 
 		 250 aa  46.6  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2948  phosphoglyceromutase  35.53 
 
 		 250 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  36.26 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0155  Phosphoglycerate mutase  33.82 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  40.62 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1329  phosphoglyceromutase  38.75 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1288  phosphoglyceromutase  35.53 
 
 		 250 aa  46.2  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.600576 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2470  phosphoglycerate mutase  35.48 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  29.91 
 
 		 228 aa  46.2  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1052  phosphoglyceromutase  39.73 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.555771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7259  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  41.18 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.0000614124  normal  0.6022 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0990  phosphoglyceromutase  39.73 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0899  phosphoglyceromutase  34.21 
 
 		 250 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0808  phosphoglyceromutase  34.21 
 
 		 250 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0867  phosphoglyceromutase  34.21 
 
 		 250 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.192858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0782  phosphoglyceromutase  34.21 
 
 		 250 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0185649  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0836  phosphoglyceromutase  34.21 
 
 		 250 aa  45.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0922  phosphoglyceromutase  34.21 
 
 		 250 aa  45.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.169898 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00708  phosphoglyceromutase  34.21 
 
 		 250 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0244194  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2887  phosphoglycerate mutase 1 family  34.21 
 
 		 250 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.715971  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0809  phosphoglyceromutase  34.21 
 
 		 250 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.794598  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2907  phosphoglyceromutase  34.21 
 
 		 250 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.314254 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0778  phosphoglyceromutase  34.21 
 
 		 250 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.170676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0676  phosphoglyceromutase  34.21 
 
 		 250 aa  45.4  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.281134  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2101  Phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 		 230 aa  45.4  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000423123 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2898  Phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 		 208 aa  45.4  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00697  hypothetical protein  34.21 
 
 		 250 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0324346  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0857  phosphoglyceromutase  34.21 
 
 		 250 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0211138  normal  0.774364 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  37.38 
 
 		 232 aa  45.4  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2663  Phosphoglycerate mutase  38.03 
 
 		 233 aa  45.4  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.610509  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1246  phosphoglyceromutase  34.21 
 
 		 250 aa  45.1  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0432438  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1164  phosphoglyceromutase  34.21 
 
 		 250 aa  45.4  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5403  Phosphoglycerate mutase  35.14 
 
 		 236 aa  45.1  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.11537 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1258  phosphoglyceromutase  32.89 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.202337  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3076  phosphoglyceromutase  32.89 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1403  phosphoglycerate mutase 1 family  36.49 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0146  phosphoglyceromutase  39.39 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000652043  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_41063  predicted protein  39.34 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.123824  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5629  phosphoglycerate mutase  45.31 
 
 		 238 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0516888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26340  fructose-2,6-bisphosphatase  33.33 
 
 		 235 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.369087  normal  0.06131 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>