200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2672 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2672  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 176 aa  352  1e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0133  Phosphoglycerate mutase  81.98 
 
 		 180 aa  266  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333661  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0137  phosphoglycerate mutase  55.56 
 
 		 184 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1396  Phosphoglycerate mutase  38.42 
 
 		 203 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0105349  normal  0.20859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2243  phosphoglycerate mutase  40.66 
 
 		 195 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1676  Phosphoglycerate mutase  37.29 
 
 		 203 aa  94.4  7e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal  0.436187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1401  phosphoglycerate mutase  37.85 
 
 		 225 aa  91.7  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118835 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92911  predicted protein  31.63 
 
 		 276 aa  63.5  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.846353  normal  0.142563 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  36.48 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  36.48 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  29.27 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  34.12 
 
 		 224 aa  57.8  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  29.88 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  25.71 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  29.52 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2210  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  42.68 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  33.53 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_013596  Sros_9413  hypothetical protein  33.52 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  35.96 
 
 		 440 aa  54.7  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0268  phosphoglycerate mutase  32.34 
 
 		 230 aa  54.3  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.293055  normal  0.887573 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.66 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  29.27 
 
 		 203 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  28.66 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1977  Phosphoglycerate mutase  27.74 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00635412  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  28.66 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  41.98 
 
 		 194 aa  53.5  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  28.66 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  28.66 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  28.66 
 
 		 203 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  33.89 
 
 		 237 aa  53.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3235  Phosphoglycerate mutase  40.25 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46353  predicted protein  26.23 
 
 		 296 aa  53.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40176  predicted protein  24.89 
 
 		 306 aa  53.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7256  Phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 		 218 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2169  putative phosphoglycerate mutase  31.41 
 
 		 208 aa  52.4  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.376393  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  31.87 
 
 		 224 aa  52.4  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0250  phosphoglycerate mutase  32.53 
 
 		 208 aa  52.4  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  42.05 
 
 		 382 aa  52.4  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4574  Phosphoglycerate mutase  40.82 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  32.74 
 
 		 204 aa  51.6  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0209  phosphoglycerate mutase family protein  26.85 
 
 		 189 aa  51.2  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000155223 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  35.87 
 
 		 201 aa  50.8  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  35.87 
 
 		 201 aa  50.8  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  29.34 
 
 		 213 aa  50.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  29.34 
 
 		 202 aa  50.8  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  29.34 
 
 		 202 aa  50.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  29.34 
 
 		 202 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  45.59 
 
 		 213 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  45.59 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1822  phosphoglycerate mutase family protein  29.63 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.125465  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3664  Phosphoglycerate mutase  44.44 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.753638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  28.25 
 
 		 411 aa  49.7  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0759  alpha-ribazole phosphatase  31.14 
 
 		 202 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0339259  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0055  Phosphoglycerate mutase  39.53 
 
 		 216 aa  48.9  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0249484  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  34.55 
 
 		 205 aa  48.9  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3303  phosphoglycerate mutase  28.93 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  40.23 
 
 		 370 aa  49.3  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01160  fructose-2,6-bisphosphatase  40.48 
 
 		 224 aa  48.9  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1876  phosphoglycerate mutase family protein  28.4 
 
 		 189 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  43.53 
 
 		 203 aa  48.9  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  30.17 
 
 		 242 aa  48.9  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 		 225 aa  48.5  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1580  phosphoglycerate mutase family protein; fructose-2,6-bisphosphatase  26.62 
 
 		 191 aa  48.1  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000315491  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  39.67 
 
 		 378 aa  48.1  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1797  Phosphoglycerate mutase  30.97 
 
 		 192 aa  48.1  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  39.24 
 
 		 189 aa  48.1  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  30.33 
 
 		 228 aa  48.1  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4432  Phosphoglycerate mutase  37.96 
 
 		 223 aa  48.1  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0783  phosphoglycerate mutase family protein  38.81 
 
 		 177 aa  48.1  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  28.4 
 
 		 207 aa  48.1  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11490  fructose-2,6-bisphosphatase  31.82 
 
 		 226 aa  47.8  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00317063 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  36.47 
 
 		 190 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1571  phosphoglycerate mutase family protein; fructose-2,6-bisphosphatase  28.4 
 
 		 191 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  36.05 
 
 		 200 aa  47.8  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0773  phosphoglycerate mutase  25.31 
 
 		 205 aa  47.8  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.880145  normal  0.0308619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8083  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 217 aa  47.8  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  34.95 
 
 		 207 aa  47.8  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1761  phosphoglycerate mutase family protein  28.4 
 
 		 191 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1619  phosphoglycerate mutase family protein  26.62 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391089  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0587  Phosphoglycerate mutase  33.97 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1745  phosphoglycerate mutase family protein  26.62 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1795  phosphoglycerate mutase family protein  26.62 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3581  phosphoglycerate mutase family protein  28.4 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  32.91 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1844  phosphoglycerate mutase  27.74 
 
 		 226 aa  47.4  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000187954  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0772  phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 		 215 aa  47  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  26.67 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  39.71 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  30.11 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1696  Phosphoglycerate mutase  31.01 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  26.16 
 
 		 209 aa  46.6  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3924  phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 		 225 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35.62 
 
 		 442 aa  45.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35.62 
 
 		 442 aa  45.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0946  phosphoglycerate mutase  32.95 
 
 		 233 aa  45.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.97615  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6122  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 214 aa  45.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.756023  normal  0.910553 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>