233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9413 on replicon NC_013596
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013596  Sros_9413  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  483  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3699  Phosphoglycerate mutase  45.87 
 
 		 253 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.155498  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3036  Phosphoglycerate mutase  42.55 
 
 		 258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.943102 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0120  phosphoglycerate mutase  42.79 
 
 		 262 aa  171  7.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1588  Phosphoglycerate mutase  39.91 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1302  Phosphoglycerate mutase  41.99 
 
 		 245 aa  144  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106982  decreased coverage  0.000409559 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02083  phosphoglycerate mutase family protein, putative  40.93 
 
 		 259 aa  142  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.956321  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0181  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  39.82 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0743  phosphoglycerate mutase  39.44 
 
 		 252 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702644  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4997  Phosphoglycerate mutase  42.8 
 
 		 238 aa  122  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1986  Phosphoglycerate mutase  41.35 
 
 		 244 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000793068  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3812  phosphoglycerate mutase  31.28 
 
 		 224 aa  74.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.234713 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3506  Phosphoglycerate mutase  32.89 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1461  phosphoglycerate mutase  31.88 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1203  phosphoglycerate mutase  24.89 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  32.31 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  34.71 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4036  phosphoglycerate mutase  24.89 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252948  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0651  phosphoglycerate mutase family protein  28.12 
 
 		 276 aa  67  0.0000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1988  Phosphoglycerate mutase  30.97 
 
 		 249 aa  65.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.455818 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  37.41 
 
 		 370 aa  65.5  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2637  phosphoglycerate mutase  24.56 
 
 		 190 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00707522  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0502  Phosphoglycerate mutase  30.13 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.309871  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0491  phosphoglycerate mutase  30.13 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.407616  normal  0.0732779 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0055  Phosphoglycerate mutase  28.63 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0249484  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 		 412 aa  63.9  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2199  Phosphoglycerate mutase  31.42 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0611897 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1314  phosphoglycerate mutase  32.74 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2672  phosphoglycerate mutase  35.2 
 
 		 176 aa  62  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  29.26 
 
 		 213 aa  62  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1121  alpha-ribazole-5`-phosphate phosphatase CobC, putative  36.61 
 
 		 198 aa  61.6  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.568184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  30.57 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  31.9 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0816  phosphoglycerate mutase  29.02 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12560  fructose-2,6-bisphosphatase  32.02 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.834883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2806  Phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  27.56 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1510  Phosphoglycerate mutase  34.38 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0365184  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  30.7 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  30.43 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  29.55 
 
 		 253 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  29.39 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  29.39 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  28.95 
 
 		 226 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  29.87 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  29.29 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1188  phosphoglycerate mutase family protein  27.49 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0344076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5245  phosphoglycerate mutase  28.32 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.611969  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  29.87 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3680  phosphoglycerate mutase  37.3 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  24.89 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1199  Phosphoglycerate mutase  31.05 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  28.77 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3949  phosphoglycerate mutase family protein  25 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  28.87 
 
 		 229 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  35.71 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  27.04 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  28.93 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  29.79 
 
 		 378 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  32.31 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  22.94 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  32.31 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  32.31 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  29.73 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3981  phosphoglycerate mutase family protein  24.35 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181997  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3846  phosphoglycerate mutase family protein  25 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000331625  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3677  phosphoglycerate mutase family protein  25 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4144  phosphoglycerate mutase family protein  25 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  30.9 
 
 		 193 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4049  phosphoglycerate mutase family protein  24.35 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00510516  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0562  phosphoglycerate mutase  34.87 
 
 		 185 aa  53.5  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434916 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2437  Phosphoglycerate mutase  27.11 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0172272 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1640  Phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 		 225 aa  52.8  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  hitchhiker  0.00334648 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  29 
 
 		 215 aa  52.4  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3358  Phosphoglycerate mutase  29.26 
 
 		 207 aa  52.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  30.32 
 
 		 214 aa  52.4  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  28.45 
 
 		 220 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  29.26 
 
 		 256 aa  52  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0330  phosphoglycerate mutase  27.47 
 
 		 233 aa  52  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.843644 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3694  phosphoglycerate mutase family protein  22.37 
 
 		 192 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0148524  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0479  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364165  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1234  phosphoglycerate mutase  28.38 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.332638 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  31.58 
 
 		 402 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2273  Phosphoglycerate mutase  33.9 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000488437  hitchhiker  0.000511721 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  29.57 
 
 		 195 aa  52  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05144  hypothetical protein similar to 6-phosphofructo-2-kinase (Eurofung)  37.08 
 
 		 700 aa  50.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0619  Phosphoglycerate mutase  26.6 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0614647  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  29.26 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  31 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  31.52 
 
 		 243 aa  50.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12447  phosphoglycerate mutase  34.27 
 
 		 223 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.74264 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  33.89 
 
 		 215 aa  51.2  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1844  phosphoglycerate mutase  26.9 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000187954  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  30.96 
 
 		 223 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  27.2 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0069  broad-specificity phosphatase PhoE  33.52 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>