140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0137 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0137  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 184 aa  372  1e-102  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2672  phosphoglycerate mutase  55.56 
 
 		 176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0133  Phosphoglycerate mutase  54.97 
 
 		 180 aa  166  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.333661  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1676  Phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 		 203 aa  107  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal  0.436187 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1396  Phosphoglycerate mutase  36.9 
 
 		 203 aa  105  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0105349  normal  0.20859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1401  phosphoglycerate mutase  37.97 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118835 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2243  phosphoglycerate mutase  36.46 
 
 		 195 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3528  phosphoglycerate mutase  29.82 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.258109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3601  phosphoglycerate mutase  29.82 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0942551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3533  phosphoglycerate mutase  29.82 
 
 		 226 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.71775 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  40.96 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92911  predicted protein  31.05 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.846353  normal  0.142563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  32.77 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  43.37 
 
 		 382 aa  55.8  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  29.19 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  28.48 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.85 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  27.85 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0265  Phosphoglycerate mutase  30.87 
 
 		 214 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0266  Phosphoglycerate mutase  30.87 
 
 		 214 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  27.22 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5474  Phosphoglycerate mutase  35.29 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20000  fructose-2,6-bisphosphatase  45.21 
 
 		 234 aa  52  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.764392  hitchhiker  0.00117347 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3985  Phosphoglycerate mutase  29.25 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.634777 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23210  fructose-2,6-bisphosphatase  30.77 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235832 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  24.84 
 
 		 208 aa  50.4  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5116  phosphoglycerate mutase  35.76 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.156451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  34.21 
 
 		 427 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  28.48 
 
 		 209 aa  49.7  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4034  phosphoglycerate mutase  39.76 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0241  phosphoglycerate mutase  32.07 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1052  phosphoglyceromutase  44.59 
 
 		 206 aa  48.5  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.555771  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0990  phosphoglyceromutase  44.59 
 
 		 206 aa  48.5  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1329  phosphoglyceromutase  44.59 
 
 		 206 aa  48.5  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  30 
 
 		 224 aa  48.1  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  34.9 
 
 		 391 aa  47.8  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  35.15 
 
 		 378 aa  47.8  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3452  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 200 aa  47.8  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  29.45 
 
 		 223 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  28.75 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01160  fructose-2,6-bisphosphatase  38.55 
 
 		 224 aa  47  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  29.05 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  28.05 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  28.1 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  29.34 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2776  Phosphoglycerate mutase  40.96 
 
 		 242 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000787137  hitchhiker  0.0000492352 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2625  phosphoglycerate mutase  36.56 
 
 		 242 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3924  phosphoglycerate mutase  30.66 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.331072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  28.75 
 
 		 203 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01873  conserved hypothetical protein  28.11 
 
 		 372 aa  46.2  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  28.75 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  27.84 
 
 		 205 aa  45.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0101  Phosphoglycerate mutase  37.65 
 
 		 203 aa  45.8  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0987  Phosphoglycerate mutase  38.27 
 
 		 224 aa  45.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0851973  normal  0.0574617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3521  Phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 		 228 aa  45.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  28.74 
 
 		 214 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1461  phosphoglycerate mutase family protein  33.14 
 
 		 237 aa  45.4  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.861833  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  32.95 
 
 		 220 aa  45.4  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1155  putative phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 		 237 aa  45.1  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0632256  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0713  putative phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 		 237 aa  45.1  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.107866  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1324  phosphoglycerate mutase family protein  33.14 
 
 		 237 aa  45.1  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0438  putative phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 		 237 aa  45.1  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1697  alpha-ribazole phosphatase  28.85 
 
 		 196 aa  45.1  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3827  Phosphoglycerate mutase  37.35 
 
 		 224 aa  45.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1822  phosphoglycerate mutase family protein  29.63 
 
 		 191 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.125465  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.31 
 
 		 378 aa  45.1  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1627  phosphoglycerate mutase  26.73 
 
 		 217 aa  45.1  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  28.75 
 
 		 203 aa  44.7  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  26.42 
 
 		 203 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  32.75 
 
 		 205 aa  44.7  0.0008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2609  Phosphoglycerate mutase  40.62 
 
 		 178 aa  44.7  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.120451 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1315  phosphoglycerate mutase family protein  33.14 
 
 		 237 aa  44.7  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  28.75 
 
 		 205 aa  44.7  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  30.34 
 
 		 412 aa  44.3  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  29.34 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1580  phosphoglycerate mutase family protein; fructose-2,6-bisphosphatase  29.17 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000315491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  28.75 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.94 
 
 		 365 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  28.24 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0250  phosphoglycerate mutase  40.74 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.12987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  40 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.94 
 
 		 365 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  29.94 
 
 		 365 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1844  phosphoglycerate mutase  32.99 
 
 		 226 aa  43.9  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000187954  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  44.29 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  30.48 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  40 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4574  Phosphoglycerate mutase  38.27 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.8 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1804  phosphoglycerate mutase, putative  32.56 
 
 		 237 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.991276  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3591  phosphoglyceromutase  46 
 
 		 206 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.863261  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0069  broad-specificity phosphatase PhoE  30.52 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0757  phosphoglycerate mutase 1 family protein  40 
 
 		 218 aa  43.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.276642  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0219  Phosphoglycerate mutase  36.14 
 
 		 238 aa  43.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  27.45 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0115  phosphoglyceromutase  41.43 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.838156  normal  0.839133 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3680  phosphoglycerate mutase  33.96 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  26.8 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  26.8 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46353  predicted protein  25.64 
 
 		 296 aa  43.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>