32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_9956 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_9956  predicted protein  100 
 
 
200 aa  417  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.841338  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37519  predicted protein  40.39 
 
 
309 aa  147  1.0000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11759  predicted protein  32.35 
 
 
197 aa  92.4  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_6725  predicted protein  28.25 
 
 
258 aa  82  0.000000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04653  conserved hypothetical protein  29.05 
 
 
329 aa  70.5  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.791672 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22821  predicted protein  31.02 
 
 
233 aa  67.8  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40227  hypothetical protein  28.04 
 
 
314 aa  64.7  0.0000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.335478 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56473  phosphoglycerate mutase  30.41 
 
 
314 aa  63.5  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.397399  normal  0.275923 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06640  conserved hypothetical protein  29.95 
 
 
238 aa  58.2  0.00000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.187359  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92911  predicted protein  27.55 
 
 
276 aa  57  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.846353  normal  0.142563 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01218  GPI anchored protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10590)  31.37 
 
 
406 aa  52  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.392776  normal  0.0162836 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40176  predicted protein  29.7 
 
 
306 aa  51.6  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_58016  phosphomutase homolog  29.23 
 
 
316 aa  49.7  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1676  Phosphoglycerate mutase  29.01 
 
 
203 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0781422  normal  0.436187 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0765  phosphoglycerate mutase family  25.81 
 
 
200 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000382364  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32020  predicted protein  32 
 
 
191 aa  47.4  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0199026 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4471  putative phosphoglycerate mutase family  24.73 
 
 
200 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0018694  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17595  predicted protein  36.26 
 
 
498 aa  47  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.372053 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0055  Phosphoglycerate mutase  26.24 
 
 
216 aa  46.6  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0249484  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4580  phosphoglycerate mutase family protein  24.04 
 
 
200 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4250  phosphoglycerate mutase family protein  24.04 
 
 
200 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000133787  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4099  phosphoglycerate mutase family protein  24.04 
 
 
200 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000493426  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4088  phosphoglycerate mutase family protein  24.04 
 
 
200 aa  45.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000489597  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4432  putative phosphoglycerate mutase family  24.04 
 
 
200 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2243  phosphoglycerate mutase  27.41 
 
 
195 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1401  phosphoglycerate mutase  29.01 
 
 
225 aa  43.9  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0118835 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44048  predicted protein  30.84 
 
 
321 aa  43.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0181  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.58 
 
 
266 aa  43.5  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2672  phosphoglycerate mutase  31.96 
 
 
176 aa  42.7  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1986  Phosphoglycerate mutase  32.93 
 
 
244 aa  42.4  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000793068  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1396  Phosphoglycerate mutase  27.78 
 
 
203 aa  42  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0105349  normal  0.20859 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00820  conserved hypothetical protein  24.37 
 
 
234 aa  41.6  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>